68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3602 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3602  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  40.07 
 
 		 323 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4732  hypothetical protein  36.31 
 
 		 310 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1666  hypothetical protein  35.22 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0140  hypothetical protein  33.83 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1831  hypothetical protein  33.93 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.281717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3199  hypothetical protein  34.02 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1325  hypothetical protein  36.17 
 
 		 323 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4133  hypothetical protein  34.91 
 
 		 332 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.346993 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8407  hypothetical protein  34.98 
 
 		 319 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  33.79 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  34.31 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  38.38 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  32.82 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3778  hypothetical protein  40.21 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  25.09 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  30.13 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  34.65 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  32.88 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  25.37 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  27.59 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  26.2 
 
 		 245 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  28.14 
 
 		 280 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  34.35 
 
 		 265 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  38.95 
 
 		 260 aa  52.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  31.78 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  34.75 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  29.34 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  33.9 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  31.54 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  29.69 
 
 		 239 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  30.4 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  40.82 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  32.38 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  28.89 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  26.5 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  36.25 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  29.57 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  27.7 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  32.03 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  29.38 
 
 		 228 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  25.94 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  30.16 
 
 		 230 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  22.18 
 
 		 230 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  36.71 
 
 		 230 aa  45.8  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  30.53 
 
 		 229 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  31.76 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  29.92 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  25.77 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  25.77 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  25.77 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  30.28 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1577  hypothetical protein  23.74 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  29.37 
 
 		 230 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  26.67 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  32.23 
 
 		 243 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  31.47 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  28.79 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  34.48 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  42.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  31.47 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  25.84 
 
 		 251 aa  42.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>