32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1666 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1666  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0140  hypothetical protein  80 
 
 		 329 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1831  hypothetical protein  71.99 
 
 		 331 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.281717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3199  hypothetical protein  71.89 
 
 		 336 aa  487  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1325  hypothetical protein  68.48 
 
 		 323 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4133  hypothetical protein  67.16 
 
 		 332 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.346993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4732  hypothetical protein  58.84 
 
 		 310 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8407  hypothetical protein  35.87 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  36.15 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3602  hypothetical protein  34.46 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  34.48 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  34.51 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  26.47 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  29.02 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  34.26 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  30.16 
 
 		 234 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  32.99 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  31.01 
 
 		 281 aa  53.1  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  32.1 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  27.96 
 
 		 219 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  31.78 
 
 		 265 aa  49.7  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  28.68 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  35.48 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  30.16 
 
 		 232 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  27.69 
 
 		 221 aa  46.6  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  27.78 
 
 		 243 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  24.73 
 
 		 263 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  24.83 
 
 		 281 aa  42.7  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  27.78 
 
 		 240 aa  42.7  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>