52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8407 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8407  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1325  hypothetical protein  38.05 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4732  hypothetical protein  40.82 
 
 		 310 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1666  hypothetical protein  36.71 
 
 		 330 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3199  hypothetical protein  34.23 
 
 		 336 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4133  hypothetical protein  34.97 
 
 		 332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.346993 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0140  hypothetical protein  35.17 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1831  hypothetical protein  35.58 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.281717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  33.45 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3602  hypothetical protein  34.36 
 
 		 276 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  28.16 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  29.87 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  35.07 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  26.03 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  29.45 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  40.48 
 
 		 287 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  36.28 
 
 		 265 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  27.95 
 
 		 227 aa  52.8  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  38.67 
 
 		 229 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  37.33 
 
 		 230 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  33.94 
 
 		 256 aa  49.7  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  32.22 
 
 		 219 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  42.11 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  29.33 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  38.75 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  37.97 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  35.11 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  37.33 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  31.43 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  29.41 
 
 		 231 aa  47  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  27.68 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  27.8 
 
 		 225 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  37.97 
 
 		 230 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  37.97 
 
 		 230 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  33.67 
 
 		 265 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  31.58 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  28.28 
 
 		 279 aa  45.8  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  30.83 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  33.71 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  34.67 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  29.8 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  26.92 
 
 		 219 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  37.97 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  37.97 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  37.97 
 
 		 230 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  27.1 
 
 		 256 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3778  hypothetical protein  26.99 
 
 		 249 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  34.67 
 
 		 228 aa  42.7  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  31.19 
 
 		 240 aa  42.4  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>