30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4732 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4732  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1325  hypothetical protein  69.35 
 
 		 323 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4133  hypothetical protein  63.83 
 
 		 332 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.346993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1831  hypothetical protein  63.14 
 
 		 331 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.281717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3199  hypothetical protein  60.91 
 
 		 336 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1666  hypothetical protein  60.19 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0140  hypothetical protein  59.13 
 
 		 329 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8407  hypothetical protein  40.82 
 
 		 319 aa  178  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  35.92 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3602  hypothetical protein  35.9 
 
 		 276 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  31.08 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  35.87 
 
 		 265 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  27.35 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  26.16 
 
 		 223 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  31.4 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  36.96 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  26.4 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  30.59 
 
 		 219 aa  50.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  32.61 
 
 		 266 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  34.09 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  24.15 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  24.63 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  36.47 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  31.71 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  32.08 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  32.18 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  37.78 
 
 		 269 aa  43.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  37.78 
 
 		 268 aa  42.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  29.73 
 
 		 265 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  34.09 
 
 		 281 aa  42.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>