34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1831 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1831  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  670    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.281717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4133  hypothetical protein  78.44 
 
 		 332 aa  524  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.346993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1325  hypothetical protein  78.85 
 
 		 323 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1666  hypothetical protein  73.65 
 
 		 330 aa  478  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3199  hypothetical protein  71.3 
 
 		 336 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0140  hypothetical protein  69.28 
 
 		 329 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4732  hypothetical protein  63.14 
 
 		 310 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.146369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8407  hypothetical protein  35.58 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0506  hypothetical protein  35.83 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3602  hypothetical protein  34.24 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3758  hypothetical protein  29.17 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  37.89 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  31.29 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  35.8 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  33.72 
 
 		 234 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  35 
 
 		 223 aa  53.5  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  38.04 
 
 		 265 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  33.7 
 
 		 266 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  36.36 
 
 		 257 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  31.82 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1664  hypothetical protein  35.23 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.886499  normal  0.578123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  31.03 
 
 		 232 aa  49.7  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  27.52 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  33.06 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5922  hypothetical protein  36.26 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  29.9 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  35.9 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  26.39 
 
 		 263 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  26 
 
 		 281 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  31.03 
 
 		 230 aa  42.7  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  31.03 
 
 		 228 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  42.7  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  36.67 
 
 		 268 aa  42.7  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 272 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>