More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0468 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  42 
 
 		 1132 aa  704    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  38.61 
 
 		 1110 aa  704    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0468  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1134 aa  2255    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  43.59 
 
 		 1146 aa  769    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  43.1 
 
 		 1118 aa  748    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  41.61 
 
 		 1196 aa  716    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1751  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  51.98 
 
 		 1129 aa  999    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.910924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0973  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  40.54 
 
 		 1155 aa  666    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117254 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  38.52 
 
 		 1110 aa  704    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  37.33 
 
 		 1182 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3622  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  37.66 
 
 		 1135 aa  605  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2005  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  35.85 
 
 		 1155 aa  600  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1076 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  33.24 
 
 		 1076 aa  547  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  32.41 
 
 		 1162 aa  266  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  28.26 
 
 		 1182 aa  147  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  27.24 
 
 		 1124 aa  141  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  27.23 
 
 		 1125 aa  137  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  26.6 
 
 		 1156 aa  137  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  30.73 
 
 		 1173 aa  135  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  26.42 
 
 		 1180 aa  134  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  26.3 
 
 		 1244 aa  132  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  26.33 
 
 		 1180 aa  132  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1177 aa  127  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.63 
 
 		 1197 aa  126  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  27.76 
 
 		 1157 aa  126  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  28.4 
 
 		 1119 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.1 
 
 		 1240 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  25.18 
 
 		 1241 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  24.35 
 
 		 1155 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.28 
 
 		 1241 aa  122  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  24.97 
 
 		 1248 aa  122  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.08 
 
 		 1241 aa  121  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  29.12 
 
 		 1106 aa  121  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.08 
 
 		 1241 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  25.22 
 
 		 1161 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.97 
 
 		 1241 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  25.08 
 
 		 1241 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.66 
 
 		 1241 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  29.69 
 
 		 1106 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  25.08 
 
 		 1241 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.08 
 
 		 1241 aa  119  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  26 
 
 		 1159 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  24.77 
 
 		 1242 aa  119  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 1080 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  25.35 
 
 		 1161 aa  116  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1057 aa  115  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  25.19 
 
 		 1183 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  22.4 
 
 		 1270 aa  112  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  25.74 
 
 		 1185 aa  111  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 1161 aa  111  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  29.64 
 
 		 1120 aa  110  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  25.54 
 
 		 1121 aa  109  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  26.29 
 
 		 1147 aa  108  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  24.47 
 
 		 1217 aa  107  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  29.25 
 
 		 1115 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  25.93 
 
 		 1180 aa  106  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  25.08 
 
 		 1183 aa  105  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  23.92 
 
 		 1173 aa  105  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.28 
 
 		 1230 aa  105  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  27.83 
 
 		 1168 aa  105  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  23.49 
 
 		 1121 aa  104  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.03 
 
 		 1183 aa  104  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  26.4 
 
 		 1392 aa  104  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 1184 aa  103  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  23.99 
 
 		 1217 aa  102  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  30.41 
 
 		 1196 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  26.53 
 
 		 1164 aa  102  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  23.99 
 
 		 1217 aa  102  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  28.46 
 
 		 1101 aa  102  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4021  UvrD/REP helicase  30.56 
 
 		 1111 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3984  UvrD/REP helicase  31.35 
 
 		 1111 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  28.75 
 
 		 1101 aa  100  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  26.63 
 
 		 1087 aa  100  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  27.96 
 
 		 1047 aa  99.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  24.62 
 
 		 1161 aa  97.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  26.18 
 
 		 1166 aa  96.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  26.43 
 
 		 1157 aa  96.3  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  27.83 
 
 		 1131 aa  95.5  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3878  UvrD/REP helicase  30.75 
 
 		 1111 aa  95.1  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  25.95 
 
 		 1089 aa  94.4  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 1095 aa  94  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.21 
 
 		 1271 aa  94.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  26.99 
 
 		 1103 aa  94.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  26.97 
 
 		 1226 aa  93.6  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3814  exonuclease V subunit beta  28.81 
 
 		 1183 aa  92.8  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.0108471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  39.84 
 
 		 1173 aa  92.8  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  24.67 
 
 		 1244 aa  92.8  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  29.27 
 
 		 659 aa  92.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.12 
 
 		 1156 aa  91.7  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3157  exonuclease V subunit beta  27.61 
 
 		 1181 aa  91.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3206  exonuclease V subunit beta  27.61 
 
 		 1181 aa  91.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.146819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3140  exonuclease V subunit beta  27.61 
 
 		 1181 aa  91.3  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  23.47 
 
 		 749 aa  91.3  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3320  exonuclease V subunit beta  27.61 
 
 		 1181 aa  91.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.602721 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  30.02 
 
 		 1240 aa  90.5  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3220  exonuclease V subunit beta  27.61 
 
 		 1181 aa  90.9  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  22.69 
 
 		 1282 aa  90.9  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  26.78 
 
 		 1117 aa  90.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  27.6 
 
 		 1189 aa  90.1  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>