More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5404 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  73.47 
 
 
438 aa  674    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  100 
 
 
457 aa  937    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  73.14 
 
 
442 aa  654    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  69.96 
 
 
453 aa  625  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  61.49 
 
 
442 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  51.17 
 
 
491 aa  418  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  47.24 
 
 
482 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  46.1 
 
 
462 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  46.07 
 
 
486 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  44.6 
 
 
457 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  45.39 
 
 
471 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  36.42 
 
 
487 aa  249  7e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  33.19 
 
 
471 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  34.26 
 
 
472 aa  233  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  31.72 
 
 
500 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  34.83 
 
 
479 aa  226  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  36.49 
 
 
453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  34.24 
 
 
495 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  35.07 
 
 
465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  36.13 
 
 
440 aa  209  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  31.65 
 
 
533 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  35 
 
 
491 aa  209  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  32.2 
 
 
452 aa  207  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  32.41 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  29.86 
 
 
539 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  33.18 
 
 
468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  31.99 
 
 
467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  31.01 
 
 
542 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  29.53 
 
 
571 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  30.09 
 
 
563 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  31.77 
 
 
497 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  34.91 
 
 
478 aa  190  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  30.95 
 
 
551 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  30.41 
 
 
510 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  32.28 
 
 
490 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  31.88 
 
 
517 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  30.7 
 
 
489 aa  186  9e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  30.21 
 
 
558 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  33.4 
 
 
488 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  30.31 
 
 
584 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  30.94 
 
 
457 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  32.61 
 
 
631 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  32.35 
 
 
474 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  29.61 
 
 
553 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  33.26 
 
 
466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  31.37 
 
 
523 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  32.55 
 
 
543 aa  177  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  28.21 
 
 
551 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  29.04 
 
 
582 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  31.45 
 
 
481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  34.29 
 
 
458 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  30.75 
 
 
470 aa  171  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  30.2 
 
 
484 aa  170  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  31.18 
 
 
481 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  28.41 
 
 
536 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  29.24 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  28.6 
 
 
541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  30.9 
 
 
459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  29.83 
 
 
486 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  30.23 
 
 
536 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  28.97 
 
 
563 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  29.25 
 
 
555 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  27.82 
 
 
553 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  29.02 
 
 
462 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  27.12 
 
 
535 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  27.12 
 
 
535 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  27.12 
 
 
535 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  29.11 
 
 
559 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  28.79 
 
 
548 aa  160  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.46 
 
 
501 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  29.11 
 
 
563 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0390  sulfatase  30.94 
 
 
464 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  27.83 
 
 
507 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  27.33 
 
 
543 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  29.64 
 
 
578 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  29.14 
 
 
483 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  28.88 
 
 
480 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  29.87 
 
 
482 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  31.64 
 
 
479 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  32.43 
 
 
637 aa  153  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  27.14 
 
 
440 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.06 
 
 
497 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  30.12 
 
 
506 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  27.79 
 
 
506 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  29.88 
 
 
480 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  28.49 
 
 
554 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  27.33 
 
 
520 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  26.51 
 
 
520 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  28.26 
 
 
497 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.26 
 
 
497 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  28.26 
 
 
497 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  30.41 
 
 
524 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  28.26 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  29.77 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  28.9 
 
 
536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  28.3 
 
 
534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  28.82 
 
 
556 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  28.41 
 
 
536 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  25.73 
 
 
526 aa  147  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3043  sulfatase  29.36 
 
 
560 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0150299  hitchhiker  0.0001034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>