More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3043 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3043  sulfatase  100 
 
 
560 aa  1130    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0150299  hitchhiker  0.0001034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  50.71 
 
 
541 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  48.15 
 
 
536 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  50.19 
 
 
536 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  49.81 
 
 
536 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  45.25 
 
 
563 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  43.94 
 
 
582 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  44.01 
 
 
578 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  43.24 
 
 
584 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  40.83 
 
 
554 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06847  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12940)  41.11 
 
 
616 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246594  normal  0.336427 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37138  Arylsulfatase (AS) (Aryl-sulfate sulphohydrolase)  41.61 
 
 
565 aa  391  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.218235  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  41.4 
 
 
534 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  41.39 
 
 
563 aa  389  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  40.36 
 
 
555 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  41.56 
 
 
556 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0870  sulfatase  40.15 
 
 
534 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.953668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  41.93 
 
 
609 aa  356  5e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3454  sulfatase  37.32 
 
 
649 aa  351  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5276  sulfatase  37.48 
 
 
649 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5130  sulfatase  36.87 
 
 
649 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.173338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2584  sulfatase  37.66 
 
 
652 aa  343  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4474  sulfatase  36.74 
 
 
648 aa  341  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3976  sulfatase  36.46 
 
 
656 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0677618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3543  sulfatase  36.46 
 
 
656 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  40.04 
 
 
596 aa  339  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5423  arylsulfatase  34.77 
 
 
660 aa  329  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.634686  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  37.62 
 
 
553 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2400  sulfatase  35.22 
 
 
589 aa  307  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0292447  hitchhiker  0.00582616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3371  arylsulfatase  35.08 
 
 
579 aa  306  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.64108  normal  0.82619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0841  arylsulfatase  32.7 
 
 
584 aa  305  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3466  arylsulfatase  35.08 
 
 
579 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3364  arylsulfatase  35.08 
 
 
579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244969  normal  0.949476 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3297  arylsulfatase  34.71 
 
 
579 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.978245  normal  0.995381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  33.57 
 
 
533 aa  297  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  34.46 
 
 
551 aa  296  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  34.03 
 
 
581 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  34.83 
 
 
543 aa  286  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0381  sulfatase  36.66 
 
 
778 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  34.1 
 
 
563 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  32.61 
 
 
571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0533  sulfatase  34.73 
 
 
796 aa  258  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  31.88 
 
 
542 aa  249  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3073  arylsulfatase  30.92 
 
 
784 aa  248  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3535  putative arylsulfatase  33.39 
 
 
759 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  33.64 
 
 
542 aa  240  5e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  33.69 
 
 
766 aa  239  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2363  sulfatase  31.01 
 
 
783 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  33.74 
 
 
772 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3832  sulfatase  30.15 
 
 
784 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3283  sulfatase  29.64 
 
 
799 aa  231  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2930  sulfatase  30.05 
 
 
798 aa  229  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0511457  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26220  arylsulfatase A family protein  33.46 
 
 
787 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3132  sulfatase  30.66 
 
 
798 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000329231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5313  sulfatase  30.3 
 
 
612 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000397774  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0733  sulfatase  30.58 
 
 
777 aa  223  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.417874  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2406  sulfatase  30.71 
 
 
775 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214932  decreased coverage  0.00167669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0111  sulfatase  30.59 
 
 
786 aa  220  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00321161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0534  sulfatase  32.67 
 
 
757 aa  220  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.966586  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0599  putative arylsulfatase  31.49 
 
 
762 aa  220  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217593  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10725  arylsulfatase atsA (aryl-sulfate sulphohydrolase)  31.22 
 
 
787 aa  220  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64546  normal  0.178722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1640  sulfatase  30.4 
 
 
822 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139745  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2521  sulfatase  33.4 
 
 
770 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.673679  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1317  sulfatase  30.54 
 
 
784 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.242414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5039  sulfatase  31.05 
 
 
783 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0252328  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3261  sulfatase  32.84 
 
 
785 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0125079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1023  sulfatase  31.04 
 
 
783 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1040  sulfatase  31.04 
 
 
783 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.088448  normal  0.214837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1085  sulfatase  30.62 
 
 
819 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.141132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13328  arylsulfatase atsB (aryl-sulfate sulphohydrolase)  31.34 
 
 
970 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00105728  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1052  sulfatase  30.69 
 
 
783 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.845593  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1901  sulfatase  29.75 
 
 
789 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3065  sulfatase  32.03 
 
 
786 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2074  sulfatase  29.75 
 
 
789 aa  210  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33405  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2516  sulfatase  31.65 
 
 
786 aa  209  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.424858  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0762  sulfatase  30.8 
 
 
773 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4647  sulfatase  28.83 
 
 
640 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2518  sulfatase  30.14 
 
 
765 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.606572  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4134  sulfatase  31.53 
 
 
788 aa  206  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10676  arylsulfatase atsD (aryl-sulfate sulphohydrolase)  31.83 
 
 
787 aa  203  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0763  sulfatase  30.28 
 
 
791 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139868  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0761  sulfatase  30.8 
 
 
785 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.492542  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4467  sulfatase  31.36 
 
 
777 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1480  sulfatase  29.85 
 
 
789 aa  201  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2516  sulfatase  30.37 
 
 
795 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3143  sulfatase  29.96 
 
 
790 aa  195  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.690214  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3964  sulfatase  31 
 
 
793 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4038  sulfatase  31 
 
 
793 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3978  sulfatase  31 
 
 
793 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0573144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2522  sulfatase  30.31 
 
 
789 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  30.32 
 
 
479 aa  189  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2372  sulfatase  29.47 
 
 
787 aa  188  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.973835  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3303  sulfatase  27.89 
 
 
849 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1858  sulfatase  30.32 
 
 
783 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4108  sulfatase  31.49 
 
 
756 aa  184  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2420  sulfatase  27.09 
 
 
840 aa  183  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.73372  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2206  sulfatase  28.73 
 
 
842 aa  182  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0228911  normal  0.614416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  30.67 
 
 
491 aa  182  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2475  sulfatase  29.74 
 
 
789 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2470  sulfatase  29.06 
 
 
786 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>