More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2516 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2374  sulfatase  66.08 
 
 		 802 aa  1122    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0111  sulfatase  46.49 
 
 		 786 aa  693    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00321161 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2372  sulfatase  56.6 
 
 		 787 aa  902    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.973835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2516  sulfatase  100 
 
 		 795 aa  1639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2522  sulfatase  55.51 
 
 		 789 aa  913    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5494  sulfatase  55.47 
 
 		 780 aa  914    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309233  normal  0.572846 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3143  sulfatase  43.09 
 
 		 790 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.690214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26220  arylsulfatase A family protein  44.33 
 
 		 787 aa  615  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0534  sulfatase  45.29 
 
 		 757 aa  613  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.966586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4108  sulfatase  45.64 
 
 		 756 aa  601  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3235  sulfatase  44.52 
 
 		 787 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3261  sulfatase  43.09 
 
 		 785 aa  595  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0125079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4134  sulfatase  42.6 
 
 		 788 aa  584  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0599  putative arylsulfatase  42.51 
 
 		 762 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13328  arylsulfatase atsB (aryl-sulfate sulphohydrolase)  42.45 
 
 		 970 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00105728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2516  sulfatase  43.39 
 
 		 786 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.424858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10676  arylsulfatase atsD (aryl-sulfate sulphohydrolase)  43.54 
 
 		 787 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1085  sulfatase  39.9 
 
 		 819 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.141132  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2470  sulfatase  41.45 
 
 		 786 aa  571  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1480  sulfatase  43.27 
 
 		 789 aa  570  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2475  sulfatase  42.33 
 
 		 789 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1640  sulfatase  42.49 
 
 		 822 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139745  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0761  sulfatase  41.92 
 
 		 785 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.492542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4467  sulfatase  41.54 
 
 		 777 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3065  sulfatase  42.2 
 
 		 786 aa  555  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0763  sulfatase  41.03 
 
 		 791 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3964  sulfatase  40.65 
 
 		 793 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4038  sulfatase  40.65 
 
 		 793 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3978  sulfatase  40.65 
 
 		 793 aa  548  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0573144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2363  sulfatase  40.32 
 
 		 783 aa  544  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2074  sulfatase  39.95 
 
 		 789 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1901  sulfatase  39.95 
 
 		 789 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2518  sulfatase  40.93 
 
 		 765 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.606572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0533  sulfatase  40.21 
 
 		 796 aa  535  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04271  sulfatase  39.9 
 
 		 786 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2521  sulfatase  40.84 
 
 		 770 aa  529  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.673679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1858  sulfatase  39.68 
 
 		 783 aa  526  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3073  arylsulfatase  37.9 
 
 		 784 aa  524  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3832  sulfatase  37.68 
 
 		 784 aa  522  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2420  sulfatase  37.45 
 
 		 840 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.73372  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3303  sulfatase  38.05 
 
 		 849 aa  513  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2206  sulfatase  36.54 
 
 		 842 aa  504  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0228911  normal  0.614416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3535  putative arylsulfatase  39.51 
 
 		 759 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1023  sulfatase  38.62 
 
 		 783 aa  479  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1040  sulfatase  38.62 
 
 		 783 aa  479  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.088448  normal  0.214837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10725  arylsulfatase atsA (aryl-sulfate sulphohydrolase)  38.04 
 
 		 787 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64546  normal  0.178722 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3283  sulfatase  38.38 
 
 		 799 aa  479  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0733  sulfatase  37.74 
 
 		 777 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.417874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0762  sulfatase  38.4 
 
 		 773 aa  476  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1317  sulfatase  37.29 
 
 		 784 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5313  sulfatase  44.61 
 
 		 612 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000397774  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1052  sulfatase  38.48 
 
 		 783 aa  475  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.845593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5039  sulfatase  37.24 
 
 		 783 aa  474  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0252328  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0936  sulfatase  36.17 
 
 		 833 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3132  sulfatase  36.88 
 
 		 798 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000329231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4647  sulfatase  43.24 
 
 		 640 aa  463  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2930  sulfatase  36.36 
 
 		 798 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0511457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2406  sulfatase  37.01 
 
 		 775 aa  440  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214932  decreased coverage  0.00167669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4358  sulfatase  37.93 
 
 		 625 aa  363  8e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0381  sulfatase  33.38 
 
 		 778 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  33.47 
 
 		 772 aa  339  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  32.57 
 
 		 766 aa  318  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  32.08 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  30.7 
 
 		 578 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  30.6 
 
 		 551 aa  247  6.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  30.93 
 
 		 563 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  29.57 
 
 		 533 aa  244  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  31.35 
 
 		 563 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  28.75 
 
 		 571 aa  224  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  31.62 
 
 		 541 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  29.53 
 
 		 542 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  29.63 
 
 		 555 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  30.78 
 
 		 543 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  29.01 
 
 		 584 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  28.57 
 
 		 553 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  28.49 
 
 		 582 aa  211  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  29.8 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  30.16 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  29.82 
 
 		 536 aa  204  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  28.21 
 
 		 563 aa  204  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06847  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12940)  28.84 
 
 		 616 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246594  normal  0.336427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  29.2 
 
 		 556 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37138  Arylsulfatase (AS) (Aryl-sulfate sulphohydrolase)  28.92 
 
 		 565 aa  199  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.218235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  28.32 
 
 		 554 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5423  arylsulfatase  27.64 
 
 		 660 aa  190  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.634686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  28.32 
 
 		 534 aa  190  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3043  sulfatase  30.02 
 
 		 560 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0150299  hitchhiker  0.0001034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0870  sulfatase  26.91 
 
 		 534 aa  187  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.953668  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2400  sulfatase  25.74 
 
 		 589 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0292447  hitchhiker  0.00582616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5276  sulfatase  26.6 
 
 		 649 aa  173  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2584  sulfatase  26.22 
 
 		 652 aa  173  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3454  sulfatase  26.44 
 
 		 649 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3976  sulfatase  26.6 
 
 		 656 aa  171  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0677618 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5130  sulfatase  26.6 
 
 		 649 aa  171  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.173338 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3543  sulfatase  26.44 
 
 		 656 aa  171  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3364  arylsulfatase  27.47 
 
 		 579 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244969  normal  0.949476 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3297  arylsulfatase  27.47 
 
 		 579 aa  170  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.978245  normal  0.995381 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3466  arylsulfatase  27.47 
 
 		 579 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3371  arylsulfatase  27.11 
 
 		 579 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.64108  normal  0.82619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  27.27 
 
 		 596 aa  168  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>