More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5313 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2521  sulfatase  56.24 
 
 
770 aa  679    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.673679  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5313  sulfatase  100 
 
 
612 aa  1267    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000397774  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4647  sulfatase  65.56 
 
 
640 aa  829    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0111  sulfatase  46.91 
 
 
786 aa  545  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00321161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3143  sulfatase  47.13 
 
 
790 aa  544  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.690214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3832  sulfatase  44.57 
 
 
784 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3073  arylsulfatase  43 
 
 
784 aa  504  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0533  sulfatase  43.46 
 
 
796 aa  505  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26220  arylsulfatase A family protein  45.78 
 
 
787 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0534  sulfatase  46.01 
 
 
757 aa  500  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.966586  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2470  sulfatase  44.35 
 
 
786 aa  500  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0761  sulfatase  44.71 
 
 
785 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.492542  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2363  sulfatase  42.21 
 
 
783 aa  495  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2516  sulfatase  46.25 
 
 
786 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.424858  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4108  sulfatase  43.72 
 
 
756 aa  491  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1640  sulfatase  43.59 
 
 
822 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139745  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4467  sulfatase  43.58 
 
 
777 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4134  sulfatase  44.19 
 
 
788 aa  478  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0599  putative arylsulfatase  42.96 
 
 
762 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217593  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10676  arylsulfatase atsD (aryl-sulfate sulphohydrolase)  44.88 
 
 
787 aa  478  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3261  sulfatase  42.57 
 
 
785 aa  472  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0125079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2516  sulfatase  44.61 
 
 
795 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3964  sulfatase  43.88 
 
 
793 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4038  sulfatase  43.88 
 
 
793 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2475  sulfatase  44.43 
 
 
789 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3978  sulfatase  43.88 
 
 
793 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0573144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3283  sulfatase  41.56 
 
 
799 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3235  sulfatase  42.41 
 
 
787 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2420  sulfatase  41.27 
 
 
840 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.73372  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3065  sulfatase  41.98 
 
 
786 aa  468  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13328  arylsulfatase atsB (aryl-sulfate sulphohydrolase)  41.91 
 
 
970 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00105728  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0763  sulfatase  41.65 
 
 
791 aa  461  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139868  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04271  sulfatase  42.93 
 
 
786 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2518  sulfatase  43.75 
 
 
765 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.606572  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1858  sulfatase  43.55 
 
 
783 aa  459  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1480  sulfatase  43.09 
 
 
789 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2074  sulfatase  41.81 
 
 
789 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33405  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1901  sulfatase  41.81 
 
 
789 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2206  sulfatase  40.56 
 
 
842 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0228911  normal  0.614416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3132  sulfatase  40.2 
 
 
798 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000329231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3303  sulfatase  40.36 
 
 
849 aa  442  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2522  sulfatase  42.47 
 
 
789 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1085  sulfatase  40.28 
 
 
819 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.141132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3535  putative arylsulfatase  41.5 
 
 
759 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5039  sulfatase  38.9 
 
 
783 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0252328  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0733  sulfatase  39.8 
 
 
777 aa  437  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.417874  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10725  arylsulfatase atsA (aryl-sulfate sulphohydrolase)  38.2 
 
 
787 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64546  normal  0.178722 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0936  sulfatase  40.34 
 
 
833 aa  435  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2374  sulfatase  41.41 
 
 
802 aa  432  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2930  sulfatase  39.37 
 
 
798 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0511457  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1023  sulfatase  38.56 
 
 
783 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1040  sulfatase  38.56 
 
 
783 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.088448  normal  0.214837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1317  sulfatase  38.19 
 
 
784 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.242414 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1052  sulfatase  38.06 
 
 
783 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.845593  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5494  sulfatase  40.03 
 
 
780 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309233  normal  0.572846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2372  sulfatase  42.06 
 
 
787 aa  422  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.973835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2406  sulfatase  37.86 
 
 
775 aa  417  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214932  decreased coverage  0.00167669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0762  sulfatase  37.48 
 
 
773 aa  411  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  36.14 
 
 
772 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4358  sulfatase  40.92 
 
 
625 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0381  sulfatase  35.74 
 
 
778 aa  332  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  34.31 
 
 
766 aa  323  5e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  31.29 
 
 
578 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  31.93 
 
 
571 aa  259  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  31.54 
 
 
581 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  32.33 
 
 
563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  31.67 
 
 
551 aa  251  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  31.35 
 
 
533 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  31.78 
 
 
553 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  31.43 
 
 
563 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  31.4 
 
 
536 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  31.33 
 
 
536 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  31.76 
 
 
542 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  31.03 
 
 
536 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  30.19 
 
 
541 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06847  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12940)  29.43 
 
 
616 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246594  normal  0.336427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2400  sulfatase  28.13 
 
 
589 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0292447  hitchhiker  0.00582616 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37138  Arylsulfatase (AS) (Aryl-sulfate sulphohydrolase)  31.87 
 
 
565 aa  226  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.218235  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  31.34 
 
 
563 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  30.25 
 
 
584 aa  223  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0870  sulfatase  29.35 
 
 
534 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.953668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3043  sulfatase  29.42 
 
 
560 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0150299  hitchhiker  0.0001034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  29.17 
 
 
534 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  28.84 
 
 
556 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  28.97 
 
 
554 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5423  arylsulfatase  29.73 
 
 
660 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.634686  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  30.16 
 
 
596 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  28.75 
 
 
582 aa  205  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  29.41 
 
 
543 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  29.2 
 
 
555 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  28.24 
 
 
609 aa  195  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3297  arylsulfatase  28.03 
 
 
579 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.978245  normal  0.995381 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3364  arylsulfatase  28.03 
 
 
579 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244969  normal  0.949476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3466  arylsulfatase  28.03 
 
 
579 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3371  arylsulfatase  28.03 
 
 
579 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.64108  normal  0.82619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0841  arylsulfatase  27.3 
 
 
584 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5130  sulfatase  27.46 
 
 
649 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.173338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4474  sulfatase  29.67 
 
 
648 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3976  sulfatase  27.68 
 
 
656 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0677618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3543  sulfatase  27.68 
 
 
656 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>