More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5423 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3454  sulfatase  54.16 
 
 		 649 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5423  arylsulfatase  100 
 
 		 660 aa  1352    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.634686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5130  sulfatase  53.36 
 
 		 649 aa  631  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.173338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4474  sulfatase  55.92 
 
 		 648 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3976  sulfatase  52.93 
 
 		 656 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0677618 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5276  sulfatase  53.38 
 
 		 649 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3543  sulfatase  53.08 
 
 		 656 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2584  sulfatase  53.32 
 
 		 652 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  39.31 
 
 		 563 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  39.04 
 
 		 584 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  38.83 
 
 		 578 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  36.88 
 
 		 536 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  36.13 
 
 		 536 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  35.92 
 
 		 536 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  36.83 
 
 		 563 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  36.85 
 
 		 582 aa  362  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  35.46 
 
 		 541 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06847  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12940)  35.51 
 
 		 616 aa  345  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246594  normal  0.336427 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37138  Arylsulfatase (AS) (Aryl-sulfate sulphohydrolase)  35.6 
 
 		 565 aa  340  5e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.218235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  35.98 
 
 		 555 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  35.42 
 
 		 556 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  34.82 
 
 		 554 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0870  sulfatase  35.12 
 
 		 534 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.953668  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  35.26 
 
 		 534 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3043  sulfatase  35.03 
 
 		 560 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0150299  hitchhiker  0.0001034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  31.34 
 
 		 596 aa  290  4e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  32.44 
 
 		 609 aa  277  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  31.74 
 
 		 551 aa  276  9e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  32.37 
 
 		 571 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  29.98 
 
 		 581 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  31.55 
 
 		 533 aa  271  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  31.66 
 
 		 563 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  32.18 
 
 		 553 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  32.13 
 
 		 543 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0841  arylsulfatase  29.48 
 
 		 584 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0381  sulfatase  32.88 
 
 		 778 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  30.61 
 
 		 542 aa  261  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3364  arylsulfatase  30.05 
 
 		 579 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244969  normal  0.949476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3466  arylsulfatase  30.05 
 
 		 579 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3297  arylsulfatase  29.89 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.978245  normal  0.995381 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3371  arylsulfatase  29.89 
 
 		 579 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.64108  normal  0.82619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  31.39 
 
 		 766 aa  247  4e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3073  arylsulfatase  30.42 
 
 		 784 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  32.01 
 
 		 772 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2400  sulfatase  29.09 
 
 		 589 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0292447  hitchhiker  0.00582616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3132  sulfatase  29.18 
 
 		 798 aa  236  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000329231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3832  sulfatase  30.88 
 
 		 784 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2930  sulfatase  29.86 
 
 		 798 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0511457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3535  putative arylsulfatase  29.64 
 
 		 759 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3283  sulfatase  27.94 
 
 		 799 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2363  sulfatase  28.33 
 
 		 783 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0733  sulfatase  28.48 
 
 		 777 aa  221  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.417874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0111  sulfatase  29.43 
 
 		 786 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00321161 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  29.92 
 
 		 542 aa  217  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2521  sulfatase  29.31 
 
 		 770 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.673679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10725  arylsulfatase atsA (aryl-sulfate sulphohydrolase)  29.9 
 
 		 787 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64546  normal  0.178722 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0533  sulfatase  28.02 
 
 		 796 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2518  sulfatase  30.92 
 
 		 765 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.606572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0762  sulfatase  27.9 
 
 		 773 aa  211  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0534  sulfatase  29.25 
 
 		 757 aa  210  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.966586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5313  sulfatase  29.73 
 
 		 612 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000397774  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2516  sulfatase  27.59 
 
 		 786 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.424858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1023  sulfatase  28.97 
 
 		 783 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1040  sulfatase  28.97 
 
 		 783 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.088448  normal  0.214837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1901  sulfatase  27.66 
 
 		 789 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1052  sulfatase  28.81 
 
 		 783 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.845593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5039  sulfatase  29.41 
 
 		 783 aa  204  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0252328  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2074  sulfatase  27.66 
 
 		 789 aa  203  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1317  sulfatase  29.27 
 
 		 784 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13328  arylsulfatase atsB (aryl-sulfate sulphohydrolase)  28.12 
 
 		 970 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00105728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1640  sulfatase  27.8 
 
 		 822 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139745  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0599  putative arylsulfatase  28.04 
 
 		 762 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4647  sulfatase  28.15 
 
 		 640 aa  200  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26220  arylsulfatase A family protein  28.64 
 
 		 787 aa  196  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2470  sulfatase  27.89 
 
 		 786 aa  193  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2516  sulfatase  27.8 
 
 		 795 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3261  sulfatase  27.8 
 
 		 785 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0125079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1085  sulfatase  26.9 
 
 		 819 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.141132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3065  sulfatase  26.93 
 
 		 786 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4467  sulfatase  27.69 
 
 		 777 aa  187  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3964  sulfatase  27.87 
 
 		 793 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4038  sulfatase  27.87 
 
 		 793 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3978  sulfatase  27.87 
 
 		 793 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0573144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2406  sulfatase  25.76 
 
 		 775 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214932  decreased coverage  0.00167669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4134  sulfatase  27.61 
 
 		 788 aa  183  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1480  sulfatase  28.93 
 
 		 789 aa  178  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2420  sulfatase  27.17 
 
 		 840 aa  178  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.73372  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5494  sulfatase  27.48 
 
 		 780 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309233  normal  0.572846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10676  arylsulfatase atsD (aryl-sulfate sulphohydrolase)  26.79 
 
 		 787 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0761  sulfatase  27.43 
 
 		 785 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.492542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4108  sulfatase  27.03 
 
 		 756 aa  176  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04271  sulfatase  26.89 
 
 		 786 aa  175  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3235  sulfatase  26.89 
 
 		 787 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3143  sulfatase  25.4 
 
 		 790 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.690214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2522  sulfatase  26.1 
 
 		 789 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2372  sulfatase  26.68 
 
 		 787 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.973835  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3303  sulfatase  26.74 
 
 		 849 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0763  sulfatase  27.66 
 
 		 791 aa  163  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2374  sulfatase  25.94 
 
 		 802 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0936  sulfatase  24.92 
 
 		 833 aa  159  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>