More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3454 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3976  sulfatase  93.9 
 
 
656 aa  1232    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0677618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4474  sulfatase  83.28 
 
 
648 aa  1059    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2584  sulfatase  94.48 
 
 
652 aa  1201    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3454  sulfatase  100 
 
 
649 aa  1330    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5423  arylsulfatase  54.16 
 
 
660 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.634686  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5130  sulfatase  92.6 
 
 
649 aa  1216    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.173338 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5276  sulfatase  98.46 
 
 
649 aa  1312    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3543  sulfatase  93.9 
 
 
656 aa  1233    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  38.03 
 
 
584 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  38.03 
 
 
536 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  37.87 
 
 
536 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  37.56 
 
 
578 aa  364  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  37.36 
 
 
563 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  38.83 
 
 
563 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  37.07 
 
 
582 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  36.35 
 
 
536 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06847  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12940)  35.49 
 
 
616 aa  339  7e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246594  normal  0.336427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  36.91 
 
 
554 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  36.93 
 
 
534 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  36.89 
 
 
555 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3043  sulfatase  38.17 
 
 
560 aa  334  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0150299  hitchhiker  0.0001034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  36.84 
 
 
556 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37138  Arylsulfatase (AS) (Aryl-sulfate sulphohydrolase)  34.79 
 
 
565 aa  329  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.218235  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  35.34 
 
 
541 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0870  sulfatase  35.66 
 
 
534 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.953668  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  33.22 
 
 
596 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  34.27 
 
 
609 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  34.06 
 
 
553 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  31.07 
 
 
551 aa  273  8.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  30.88 
 
 
581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  31.31 
 
 
563 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0381  sulfatase  32.01 
 
 
778 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0841  arylsulfatase  28.01 
 
 
584 aa  241  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  31.87 
 
 
533 aa  241  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2400  sulfatase  30.98 
 
 
589 aa  241  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0292447  hitchhiker  0.00582616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3364  arylsulfatase  30.94 
 
 
579 aa  237  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244969  normal  0.949476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3466  arylsulfatase  30.94 
 
 
579 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  30.14 
 
 
542 aa  236  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  30.95 
 
 
543 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3297  arylsulfatase  30.77 
 
 
579 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.978245  normal  0.995381 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3371  arylsulfatase  30.94 
 
 
579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.64108  normal  0.82619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  29.85 
 
 
571 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2930  sulfatase  30.39 
 
 
798 aa  223  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0511457  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3073  arylsulfatase  28.41 
 
 
784 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  30.72 
 
 
766 aa  212  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3132  sulfatase  29.84 
 
 
798 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000329231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2521  sulfatase  30.92 
 
 
770 aa  207  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.673679  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  29.87 
 
 
542 aa  206  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2363  sulfatase  28.59 
 
 
783 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0533  sulfatase  30.65 
 
 
796 aa  200  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3535  putative arylsulfatase  30.72 
 
 
759 aa  200  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  29.53 
 
 
772 aa  200  9e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3832  sulfatase  28.5 
 
 
784 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3283  sulfatase  26.51 
 
 
799 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0733  sulfatase  27.06 
 
 
777 aa  194  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.417874  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0111  sulfatase  29.46 
 
 
786 aa  190  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00321161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10725  arylsulfatase atsA (aryl-sulfate sulphohydrolase)  29 
 
 
787 aa  190  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64546  normal  0.178722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2406  sulfatase  27.06 
 
 
775 aa  189  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214932  decreased coverage  0.00167669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13328  arylsulfatase atsB (aryl-sulfate sulphohydrolase)  27.9 
 
 
970 aa  187  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00105728  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0534  sulfatase  29.35 
 
 
757 aa  187  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.966586  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1085  sulfatase  28.64 
 
 
819 aa  186  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.141132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2518  sulfatase  29.87 
 
 
765 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.606572  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5039  sulfatase  28.25 
 
 
783 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0252328  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0599  putative arylsulfatase  28.57 
 
 
762 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217593  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0762  sulfatase  27.1 
 
 
773 aa  180  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1317  sulfatase  28.1 
 
 
784 aa  180  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.242414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5313  sulfatase  27.08 
 
 
612 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000397774  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0761  sulfatase  28.52 
 
 
785 aa  177  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.492542  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1640  sulfatase  28.66 
 
 
822 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139745  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2516  sulfatase  26.6 
 
 
795 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1023  sulfatase  27.58 
 
 
783 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1040  sulfatase  27.58 
 
 
783 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.088448  normal  0.214837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4467  sulfatase  27.45 
 
 
777 aa  173  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2516  sulfatase  28.14 
 
 
786 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.424858  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3065  sulfatase  28.21 
 
 
786 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1901  sulfatase  27.39 
 
 
789 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2074  sulfatase  27.39 
 
 
789 aa  170  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33405  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1052  sulfatase  27.26 
 
 
783 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.845593  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2372  sulfatase  27.61 
 
 
787 aa  167  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.973835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1480  sulfatase  27.14 
 
 
789 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2374  sulfatase  26.41 
 
 
802 aa  166  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3964  sulfatase  28.92 
 
 
793 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26220  arylsulfatase A family protein  27.23 
 
 
787 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4038  sulfatase  28.92 
 
 
793 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3978  sulfatase  28.92 
 
 
793 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0573144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2522  sulfatase  26.67 
 
 
789 aa  164  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3261  sulfatase  26.58 
 
 
785 aa  163  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0125079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4108  sulfatase  26.65 
 
 
756 aa  161  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4134  sulfatase  27.99 
 
 
788 aa  161  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4647  sulfatase  25.75 
 
 
640 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04271  sulfatase  27.18 
 
 
786 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2475  sulfatase  26.58 
 
 
789 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10676  arylsulfatase atsD (aryl-sulfate sulphohydrolase)  27.23 
 
 
787 aa  153  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2420  sulfatase  26.81 
 
 
840 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.73372  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2470  sulfatase  26.79 
 
 
786 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1858  sulfatase  27.87 
 
 
783 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0763  sulfatase  27.08 
 
 
791 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139868  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3303  sulfatase  27.56 
 
 
849 aa  150  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2206  sulfatase  26.5 
 
 
842 aa  145  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0228911  normal  0.614416 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5494  sulfatase  25.79 
 
 
780 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309233  normal  0.572846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>