More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1640 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3303  sulfatase  43.32 
 
 		 849 aa  643    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10676  arylsulfatase atsD (aryl-sulfate sulphohydrolase)  53.28 
 
 		 787 aa  791    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3261  sulfatase  50.67 
 
 		 785 aa  745    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0125079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0111  sulfatase  52.37 
 
 		 786 aa  822    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00321161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0534  sulfatase  48.02 
 
 		 757 aa  707    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.966586  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2470  sulfatase  47.12 
 
 		 786 aa  690    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1640  sulfatase  100 
 
 		 822 aa  1703    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139745  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0763  sulfatase  51.05 
 
 		 791 aa  761    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3964  sulfatase  53.7 
 
 		 793 aa  775    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2420  sulfatase  43.23 
 
 		 840 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.73372  normal  0.229753 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26220  arylsulfatase A family protein  50.19 
 
 		 787 aa  788    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2206  sulfatase  46.1 
 
 		 842 aa  643    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0228911  normal  0.614416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3065  sulfatase  54.73 
 
 		 786 aa  793    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1480  sulfatase  53.75 
 
 		 789 aa  770    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2074  sulfatase  54.08 
 
 		 789 aa  855    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1901  sulfatase  54.33 
 
 		 789 aa  857    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4134  sulfatase  53.75 
 
 		 788 aa  796    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4038  sulfatase  53.7 
 
 		 793 aa  775    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2516  sulfatase  44.94 
 
 		 786 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.424858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4467  sulfatase  53.04 
 
 		 777 aa  777    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0761  sulfatase  50.26 
 
 		 785 aa  741    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.492542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2475  sulfatase  50.99 
 
 		 789 aa  774    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04271  sulfatase  52.9 
 
 		 786 aa  787    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3235  sulfatase  45.43 
 
 		 787 aa  698    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3978  sulfatase  53.7 
 
 		 793 aa  775    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0573144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4108  sulfatase  45.83 
 
 		 756 aa  668    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3143  sulfatase  48.61 
 
 		 790 aa  739    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.690214  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1085  sulfatase  64.85 
 
 		 819 aa  1015    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.141132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0599  putative arylsulfatase  82.55 
 
 		 762 aa  1324    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1858  sulfatase  45.31 
 
 		 783 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.190386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2518  sulfatase  45.4 
 
 		 765 aa  629  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.606572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0936  sulfatase  43.09 
 
 		 833 aa  618  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0533  sulfatase  41.68 
 
 		 796 aa  600  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3073  arylsulfatase  40.92 
 
 		 784 aa  595  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3832  sulfatase  40.54 
 
 		 784 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3283  sulfatase  41.86 
 
 		 799 aa  590  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2363  sulfatase  40.32 
 
 		 783 aa  582  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3132  sulfatase  41.68 
 
 		 798 aa  579  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000329231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0733  sulfatase  41.12 
 
 		 777 aa  581  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.417874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2521  sulfatase  43.14 
 
 		 770 aa  581  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.673679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13328  arylsulfatase atsB (aryl-sulfate sulphohydrolase)  41.72 
 
 		 970 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00105728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2522  sulfatase  42.11 
 
 		 789 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2930  sulfatase  41.31 
 
 		 798 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0511457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2516  sulfatase  42.49 
 
 		 795 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0762  sulfatase  40.83 
 
 		 773 aa  554  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2372  sulfatase  42.39 
 
 		 787 aa  551  1e-155  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.973835  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2374  sulfatase  39.13 
 
 		 802 aa  544  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2406  sulfatase  40.67 
 
 		 775 aa  541  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214932  decreased coverage  0.00167669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5039  sulfatase  39.11 
 
 		 783 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0252328  normal  0.170532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1023  sulfatase  39.58 
 
 		 783 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1040  sulfatase  39.58 
 
 		 783 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.088448  normal  0.214837 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1052  sulfatase  39.45 
 
 		 783 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.845593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1317  sulfatase  38.5 
 
 		 784 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10725  arylsulfatase atsA (aryl-sulfate sulphohydrolase)  37.84 
 
 		 787 aa  521  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64546  normal  0.178722 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5494  sulfatase  39.69 
 
 		 780 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309233  normal  0.572846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3535  putative arylsulfatase  37.15 
 
 		 759 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4647  sulfatase  45.87 
 
 		 640 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5313  sulfatase  43.59 
 
 		 612 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000397774  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4358  sulfatase  37.52 
 
 		 625 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0381  sulfatase  33.01 
 
 		 778 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  32.84 
 
 		 772 aa  345  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  32.8 
 
 		 766 aa  323  7e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  32.74 
 
 		 578 aa  278  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  32.81 
 
 		 571 aa  260  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  31.53 
 
 		 536 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  33.21 
 
 		 563 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  31.15 
 
 		 542 aa  243  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  29.35 
 
 		 581 aa  242  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  29.37 
 
 		 553 aa  240  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  31.24 
 
 		 543 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  29.74 
 
 		 551 aa  237  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  30.31 
 
 		 541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  30.68 
 
 		 563 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0870  sulfatase  30.89 
 
 		 534 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.953668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  29.89 
 
 		 536 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  29.84 
 
 		 536 aa  225  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  29.66 
 
 		 582 aa  223  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  29.91 
 
 		 533 aa  220  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37138  Arylsulfatase (AS) (Aryl-sulfate sulphohydrolase)  28.33 
 
 		 565 aa  219  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.218235  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06847  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12940)  28.03 
 
 		 616 aa  217  5.9999999999999996e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246594  normal  0.336427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  29.85 
 
 		 584 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2400  sulfatase  28.75 
 
 		 589 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0292447  hitchhiker  0.00582616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  29.87 
 
 		 563 aa  212  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  28.62 
 
 		 555 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  30.51 
 
 		 609 aa  208  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3043  sulfatase  30.4 
 
 		 560 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0150299  hitchhiker  0.0001034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5423  arylsulfatase  27.8 
 
 		 660 aa  202  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.634686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  28.31 
 
 		 556 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  28.84 
 
 		 554 aa  194  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  28.44 
 
 		 534 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  27.75 
 
 		 596 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5130  sulfatase  28.18 
 
 		 649 aa  180  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.173338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4474  sulfatase  27.83 
 
 		 648 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3543  sulfatase  28.93 
 
 		 656 aa  177  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3454  sulfatase  28.34 
 
 		 649 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3364  arylsulfatase  25.69 
 
 		 579 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244969  normal  0.949476 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3976  sulfatase  28.93 
 
 		 656 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0677618 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3371  arylsulfatase  25.69 
 
 		 579 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.64108  normal  0.82619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3466  arylsulfatase  25.69 
 
 		 579 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5276  sulfatase  28.18 
 
 		 649 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>