More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0248 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  97.13 
 
 
383 aa  760  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  100 
 
 
383 aa  782  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  53.81 
 
 
398 aa  409  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  54.13 
 
 
384 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  54.29 
 
 
398 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  52.09 
 
 
398 aa  405  1e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  54.35 
 
 
384 aa  407  1e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  53.65 
 
 
399 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  53.14 
 
 
396 aa  401  1e-110  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  51.05 
 
 
393 aa  397  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  51.56 
 
 
394 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  51.79 
 
 
409 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 
392 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  51.82 
 
 
388 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.31678e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  56.47 
 
 
395 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  50.78 
 
 
400 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  50.13 
 
 
398 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.01074e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  51.21 
 
 
382 aa  383  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  49.35 
 
 
404 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  49.74 
 
 
403 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  49.22 
 
 
398 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  49.22 
 
 
398 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  49.34 
 
 
396 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.40569e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  49.74 
 
 
396 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  49.61 
 
 
394 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.84465e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  48.17 
 
 
382 aa  371  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  48.17 
 
 
392 aa  368  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  49.47 
 
 
389 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  51.58 
 
 
390 aa  363  2e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  50.52 
 
 
388 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  50.52 
 
 
403 aa  363  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  8.59331e-07 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  49.87 
 
 
402 aa  362  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  6.04426e-06 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  49.22 
 
 
393 aa  362  7e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  50.13 
 
 
417 aa  362  7e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  50.13 
 
 
403 aa  356  3e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  46.3 
 
 
388 aa  355  9e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  51.3 
 
 
392 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  46.46 
 
 
414 aa  353  3e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.61511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  47.64 
 
 
401 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  47.64 
 
 
401 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  49.61 
 
 
405 aa  349  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  49.47 
 
 
379 aa  349  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  48.83 
 
 
394 aa  349  6e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  50 
 
 
390 aa  348  1e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.7 
 
 
400 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  49.74 
 
 
389 aa  346  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  49.21 
 
 
388 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  47.93 
 
 
507 aa  344  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  48.18 
 
 
407 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  46.15 
 
 
383 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  48.18 
 
 
407 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  48.18 
 
 
407 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  48.18 
 
 
407 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  48.18 
 
 
407 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  47.41 
 
 
404 aa  343  3e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  48.44 
 
 
403 aa  343  3e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  47.92 
 
 
407 aa  343  3e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  47.92 
 
 
407 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  47.92 
 
 
407 aa  342  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  47.88 
 
 
404 aa  341  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  49.21 
 
 
388 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  46.3 
 
 
395 aa  340  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  47.66 
 
 
407 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  47.66 
 
 
407 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  49.87 
 
 
388 aa  341  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  47.4 
 
 
407 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0410  cysteine desulfurase  47.53 
 
 
422 aa  341  2e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  46.32 
 
 
407 aa  340  3e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  46.51 
 
 
399 aa  340  3e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0592  cysteine desulfurase  49.74 
 
 
404 aa  340  3e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0618  cysteine desulfurase  49.74 
 
 
404 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  47.4 
 
 
407 aa  339  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  46.61 
 
 
405 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  46.61 
 
 
405 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  49.33 
 
 
387 aa  339  6e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  49.48 
 
 
404 aa  339  6e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  47.4 
 
 
407 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  47.4 
 
 
407 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  47.4 
 
 
407 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  47.21 
 
 
381 aa  338  1e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  46.63 
 
 
493 aa  338  1e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  47.41 
 
 
404 aa  337  2e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  4.39392e-05 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  46.95 
 
 
381 aa  337  2e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  45.55 
 
 
402 aa  336  3e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  48.79 
 
 
383 aa  336  3e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  46.75 
 
 
410 aa  336  4e-91  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  50.79 
 
 
399 aa  336  4e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  46.09 
 
 
405 aa  336  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  46.7 
 
 
398 aa  335  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  47.12 
 
 
401 aa  335  6e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  45.79 
 
 
393 aa  335  7e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  46.35 
 
 
407 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  46.3 
 
 
389 aa  335  8e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  46.88 
 
 
405 aa  335  8e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  46.88 
 
 
405 aa  335  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  47.15 
 
 
404 aa  334  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.28828e-08 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  46.03 
 
 
389 aa  334  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  47.48 
 
 
383 aa  335  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  47.93 
 
 
404 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  45.77 
 
 
389 aa  333  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>