57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2096 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  100 
 
 
1051 aa  2179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  30.63 
 
 
895 aa  244  4e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  6.96733e-12 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  33.27 
 
 
582 aa  238  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  30.59 
 
 
890 aa  235  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  30.59 
 
 
890 aa  235  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  32.59 
 
 
631 aa  232  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  32.45 
 
 
591 aa  223  1e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  33.85 
 
 
689 aa  221  4e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  31.67 
 
 
950 aa  221  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  31.13 
 
 
911 aa  219  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  31.2 
 
 
955 aa  218  6e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  28.4 
 
 
979 aa  218  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  34.27 
 
 
953 aa  217  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  33.49 
 
 
958 aa  217  1e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  33.49 
 
 
958 aa  217  1e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  34.27 
 
 
950 aa  216  2e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  34.27 
 
 
955 aa  216  2e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  32.04 
 
 
627 aa  215  3e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  30.52 
 
 
633 aa  214  5e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  34.04 
 
 
953 aa  214  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  29.1 
 
 
676 aa  208  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  29.17 
 
 
658 aa  207  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  32.59 
 
 
556 aa  197  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  26.14 
 
 
841 aa  194  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  31.66 
 
 
515 aa  188  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  30.92 
 
 
580 aa  187  1e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  34.73 
 
 
574 aa  186  2e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  25.56 
 
 
930 aa  185  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  28.86 
 
 
929 aa  175  3e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  30.48 
 
 
711 aa  170  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  29.7 
 
 
553 aa  170  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  27.09 
 
 
845 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  29.47 
 
 
899 aa  160  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.12 
 
 
713 aa  157  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  1.09484e-07 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  29.73 
 
 
878 aa  151  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  33.77 
 
 
295 aa  129  2e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  24.85 
 
 
1000 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  26.24 
 
 
580 aa  100  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  30.38 
 
 
443 aa  92.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  35.1 
 
 
280 aa  91.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  34.88 
 
 
383 aa  89  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  29.76 
 
 
709 aa  79.7  2e-13  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  28.45 
 
 
842 aa  75.5  5e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  30.58 
 
 
597 aa  67.4  2e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  28.96 
 
 
897 aa  66.2  3e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  30.94 
 
 
597 aa  66.6  3e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  30.94 
 
 
597 aa  66.6  3e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  25.86 
 
 
970 aa  64.3  1e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  27.18 
 
 
970 aa  63.2  3e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  33.81 
 
 
298 aa  61.6  8e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  33.81 
 
 
298 aa  61.6  8e-08  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  22.62 
 
 
624 aa  58.9  4e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  30.1 
 
 
987 aa  51.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2286  hypothetical protein  33.64 
 
 
125 aa  50.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  29.53 
 
 
738 aa  48.9  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  31.45 
 
 
277 aa  47.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  31.3 
 
 
590 aa  47.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>