More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0708 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_16881  elongation factor Tu  78 
 
 		 399 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17111  elongation factor Tu  78.97 
 
 		 399 aa  656    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23641  elongation factor Tu  77.26 
 
 		 399 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19491  elongation factor Tu  78.24 
 
 		 399 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1074  elongation factor Tu  78 
 
 		 399 aa  653    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1287  elongation factor Tu  88.26 
 
 		 409 aa  708    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 399 aa  647    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1600  elongation factor Tu  78.97 
 
 		 399 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0884  elongation factor Tu  80.93 
 
 		 409 aa  660    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.669879  hitchhiker  0.000241501 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16311  elongation factor Tu  78.73 
 
 		 399 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0708  elongation factor Tu  100 
 
 		 409 aa  832    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1561  elongation factor Tu  81.66 
 
 		 409 aa  669    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.052718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0662  translation elongation factor Tu  89.98 
 
 		 409 aa  728    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0150791  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16991  elongation factor Tu  78.97 
 
 		 399 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0476  elongation factor Tu  82.15 
 
 		 409 aa  671    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1536  elongation factor Tu  81.66 
 
 		 409 aa  669    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0049  elongation factor Tu  80.73 
 
 		 410 aa  661    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2022  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 399 aa  628  1e-179  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.466852  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2621  translation elongation factor Tu  71.71 
 
 		 405 aa  609  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1184  translation elongation factor Tu  71.46 
 
 		 405 aa  607  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000189456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  71.46 
 
 		 405 aa  604  9.999999999999999e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000740208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  71.46 
 
 		 405 aa  604  9.999999999999999e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  71.81 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  70.98 
 
 		 400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  71.81 
 
 		 400 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  71.22 
 
 		 395 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  70.49 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  71.88 
 
 		 399 aa  600  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  70 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  67.32 
 
 		 405 aa  595  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  67.32 
 
 		 405 aa  595  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  70.73 
 
 		 399 aa  597  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  70.66 
 
 		 399 aa  592  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  71.15 
 
 		 397 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  71.15 
 
 		 397 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  70.27 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  70 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  70 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  69.29 
 
 		 394 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  69.29 
 
 		 394 aa  588  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  70 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  69.19 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  69.93 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  69.93 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  69.93 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  69.19 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  69.93 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  69.29 
 
 		 394 aa  586  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  69.29 
 
 		 394 aa  586  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  68.78 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  68.19 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  69.51 
 
 		 400 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  68.95 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  68.95 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  68.78 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  68.38 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 400 aa  581  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  69.19 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  68.7 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  69.44 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  68.95 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  68.95 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  68.46 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  68.22 
 
 		 395 aa  580  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  68.22 
 
 		 395 aa  580  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  69.12 
 
 		 394 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  69.12 
 
 		 394 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  68.38 
 
 		 400 aa  581  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  68.29 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  69.19 
 
 		 400 aa  579  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  69.44 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  68.37 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  68.46 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  68.46 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  69.04 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  68.87 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  70.1 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  70.1 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  68.7 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  68.7 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  68.7 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000951262  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  68.7 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  68.7 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  68.7 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2974  elongation factor Tu  69.44 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  68.7 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  69.61 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  69.61 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  68.7 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  68.7 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  68.7 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000303162  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  69.19 
 
 		 391 aa  575  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  69.19 
 
 		 391 aa  575  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  68.7 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000406645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>