39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0255 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0255  UspA domain protein  100 
 
 
291 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955091  normal  0.331109 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1011  UspA domain protein  40.07 
 
 
292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000787918 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2244  UspA domain protein  39.93 
 
 
292 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.616395 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2182  UspA domain protein  39.93 
 
 
292 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  25.51 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  27.99 
 
 
281 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1767  hypothetical protein  26.21 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  25.95 
 
 
293 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  25.95 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  25.26 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  23.19 
 
 
300 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  27.57 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  24.41 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  27.03 
 
 
295 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  25.65 
 
 
279 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1158  UspA domain-containing protein  21.89 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  24.81 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  27.86 
 
 
148 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  21.96 
 
 
307 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  31.29 
 
 
151 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  23.47 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  21.24 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  33.33 
 
 
136 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  24.34 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  23.42 
 
 
297 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  24.26 
 
 
208 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  24.64 
 
 
290 aa  45.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0473  hypothetical protein  29.41 
 
 
282 aa  46.2  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.203309  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  27.57 
 
 
282 aa  45.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  22.91 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  36.71 
 
 
148 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  30 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  25.41 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  24.49 
 
 
148 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  22.27 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  24.41 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  21.23 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  38.89 
 
 
147 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  22.81 
 
 
288 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>