More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2090 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2090  inner-membrane translocator  100 
 
 
335 aa  640  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.268162 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4121  inner-membrane translocator  52.15 
 
 
328 aa  277  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49492  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1049  inner-membrane translocator  46.71 
 
 
340 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186781  normal  0.0406542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2302  inner-membrane translocator  49.2 
 
 
327 aa  255  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0887388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2214  inner-membrane translocator  48.49 
 
 
324 aa  240  3e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.543943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3645  inner-membrane translocator  41.95 
 
 
327 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3208  L-arabinose transporter permease protein  37.27 
 
 
339 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4590  L-arabinose transporter permease protein  37.05 
 
 
337 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280966 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5220  L-arabinose transporter permease protein  37.05 
 
 
341 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5639  L-arabinose transporter permease protein  37.05 
 
 
341 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356357  normal  0.0453459 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5474  L-arabinose transporter permease protein  36.36 
 
 
335 aa  182  9e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4919  L-arabinose transporter permease protein  36.36 
 
 
339 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.259607  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0077  inner-membrane translocator  43.93 
 
 
331 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4219  L-arabinose transporter permease protein  37.42 
 
 
338 aa  179  5e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.645331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3962  L-arabinose transporter permease protein  38.41 
 
 
334 aa  179  5e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1626  L-arabinose transporter permease protein  35.89 
 
 
339 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  39.66 
 
 
312 aa  174  1e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  33.24 
 
 
346 aa  173  4e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  34.82 
 
 
343 aa  172  7e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  34.52 
 
 
343 aa  172  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1910  L-arabinose transporter permease protein  36.25 
 
 
328 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2613  L-arabinose transporter permease protein  32.44 
 
 
338 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727228  normal  0.716925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3763  L-arabinose transporter permease protein  33.66 
 
 
316 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139254  normal  0.990186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2995  L-arabinose transporter permease protein  34.9 
 
 
335 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.397713  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  33.92 
 
 
345 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2585  L-arabinose transporter permease protein  34.9 
 
 
335 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2756  L-arabinose transporter permease protein  34.77 
 
 
335 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.394625  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  38.1 
 
 
330 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  6.2023e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  38.1 
 
 
330 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
345 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  34.58 
 
 
345 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  38.1 
 
 
330 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
345 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3775  L-arabinose transporter permease protein  35.08 
 
 
315 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  36.01 
 
 
350 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1021  L-arabinose transporter permease protein  37.46 
 
 
333 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3446  L-arabinose transporter permease protein  33.95 
 
 
334 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3475  L-arabinose transporter permease protein  33.9 
 
 
316 aa  166  6e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0047  L-arabinose transporter permease protein  38.13 
 
 
339 aa  166  7e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149615  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0524  L-arabinose transporter permease protein  32.41 
 
 
338 aa  165  1e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299001  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2762  L-arabinose transporter permease protein  32.41 
 
 
338 aa  165  1e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.84256  normal  0.399817 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3484  L-arabinose transporter permease protein  34.08 
 
 
334 aa  164  2e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0404  L-arabinose transporter permease protein  34.08 
 
 
334 aa  164  2e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.15645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1264  L-arabinose transporter permease protein  34.08 
 
 
334 aa  164  2e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3301  L-arabinose transporter permease protein  34.08 
 
 
334 aa  164  2e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34.7 
 
 
317 aa  164  2e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  6.22557e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0548  L-arabinose transporter permease protein  32.1 
 
 
338 aa  164  2e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0287231  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  35.62 
 
 
311 aa  164  2e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  35.62 
 
 
311 aa  164  2e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3705  L-arabinose transporter permease protein  32.41 
 
 
338 aa  164  2e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3482  L-arabinose transporter permease protein  34.08 
 
 
334 aa  164  2e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  35.95 
 
 
311 aa  164  2e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2484  L-arabinose transporter permease protein  34.08 
 
 
334 aa  164  2e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  36.99 
 
 
333 aa  163  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 
311 aa  163  4e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2147  L-arabinose transporter permease protein  36.01 
 
 
328 aa  163  4e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  35.62 
 
 
311 aa  163  4e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  35.79 
 
 
306 aa  163  5e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  35.29 
 
 
311 aa  163  5e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.04 
 
 
345 aa  162  5e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33.53 
 
 
347 aa  163  5e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0140  L-arabinose transporter permease protein  32.1 
 
 
338 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0623  L-arabinose transporter permease protein  32.1 
 
 
338 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000899793  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0591  L-arabinose transporter permease protein  32.1 
 
 
338 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257552  normal  0.0412649 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
311 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 
311 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.30424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
311 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
311 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 
342 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  33.53 
 
 
342 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 
345 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  35.38 
 
 
327 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  3.58536e-06 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1181  L-arabinose transporter permease protein  34.65 
 
 
334 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  38.44 
 
 
336 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  33.86 
 
 
334 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
314 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1872  sugar transport system permease  32 
 
 
342 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  36.96 
 
 
348 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2971  ribose ABC transporter, permease protein  32 
 
 
342 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3043  monosaccharide-transporting ATPase  32 
 
 
342 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  37.15 
 
 
322 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.29 
 
 
311 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.52632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  36.71 
 
 
322 aa  159  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  36.71 
 
 
323 aa  159  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0548  L-arabinose transporter permease protein  32.44 
 
 
338 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0318738  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  35.19 
 
 
333 aa  158  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4348  inner-membrane translocator  38.87 
 
 
348 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  37.38 
 
 
316 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  37.67 
 
 
324 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  37.84 
 
 
328 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0561  inner-membrane translocator  36.39 
 
 
338 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  38.06 
 
 
335 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3409  L-arabinose transporter permease protein  32.11 
 
 
338 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0925142  normal  0.0828764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2600  L-arabinose transporter permease protein  34.55 
 
 
336 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860073  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  37.29 
 
 
336 aa  156  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  33.63 
 
 
348 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  1.46759e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2031  L-arabinose transporter permease protein  34.07 
 
 
328 aa  156  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  35.67 
 
 
324 aa  155  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  34.66 
 
 
338 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  37.24 
 
 
322 aa  154  3e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>