More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3073 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  100 
 
 		 223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.59 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  36.61 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  40 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  39.46 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.49 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  33.98 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  33.82 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.62 
 
 		 220 aa  111  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.35 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.74 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.11 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  37.33 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  35.68 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  34.8 
 
 		 728 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.98 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.14 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  32.54 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.28 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.3 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  35.64 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.67 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2637  HAD family hydrolase  37.11 
 
 		 286 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  29.59 
 
 		 217 aa  104  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.22 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.45 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  32.08 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 456 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2632  HAD family hydrolase  33.7 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  33.15 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  31.55 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.33 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 396 aa  101  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1853  HAD family hydrolase  34.39 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147437  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  33.01 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  28.92 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.34 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.98 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  29.02 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.34 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.72 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.18 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.33 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  31.03 
 
 		 188 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  32.06 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  31.03 
 
 		 188 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2888  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  31.03 
 
 		 188 aa  99.8  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.11 
 
 		 226 aa  99.4  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281035  normal  0.462582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.95 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.29 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  30.34 
 
 		 188 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  30.34 
 
 		 188 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  30.34 
 
 		 188 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  30.34 
 
 		 188 aa  99  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  34.76 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  34.76 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.82 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  31.79 
 
 		 456 aa  98.6  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.15 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.33 
 
 		 235 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  28.49 
 
 		 188 aa  98.2  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.19 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.41 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.85 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  33.17 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  32.26 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  32.82 
 
 		 456 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  34.44 
 
 		 707 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  34.44 
 
 		 707 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  29.41 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.29 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.72 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.28 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  29.78 
 
 		 188 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  34.44 
 
 		 714 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  33.52 
 
 		 762 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  29.78 
 
 		 188 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  29.78 
 
 		 188 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.39 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.57 
 
 		 235 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2172  HAD family hydrolase  34.44 
 
 		 710 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  33.8 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  31.44 
 
 		 212 aa  95.5  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  32.98 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  34.95 
 
 		 221 aa  94.7  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  30.34 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  29.82 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  30.18 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4056  HAD family hydrolase  32.7 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>