More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1010 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  100 
 
 		 411 aa  853    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  70.44 
 
 		 406 aa  620  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  66 
 
 		 405 aa  567  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  57.11 
 
 		 406 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  57.32 
 
 		 409 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  57.07 
 
 		 409 aa  510  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  56.3 
 
 		 411 aa  491  1e-137  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  57.14 
 
 		 408 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  56.47 
 
 		 419 aa  481  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  55.77 
 
 		 407 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  52.72 
 
 		 426 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  53.83 
 
 		 404 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  51.48 
 
 		 403 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  50.74 
 
 		 404 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  52.33 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  51.6 
 
 		 439 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  51.48 
 
 		 412 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  48.59 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  50.24 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  49.03 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  49.26 
 
 		 420 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  46.32 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  46.32 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  46.32 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  46.32 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  46.32 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  46.32 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  46.32 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  46.32 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  46.08 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  46.08 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  46.08 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  46.31 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  48.54 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  45.64 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  45.59 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  45.1 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  46.19 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  45.59 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  45.59 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  45.04 
 
 		 411 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  43.52 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  43.81 
 
 		 428 aa  363  2e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  44.58 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  45.83 
 
 		 406 aa  363  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  42.82 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  41.7 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  41.47 
 
 		 467 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  41.65 
 
 		 452 aa  338  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2273  peptidase U32  40.73 
 
 		 458 aa  334  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  41.36 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  40.77 
 
 		 454 aa  332  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2783  peptidase U32  40.52 
 
 		 458 aa  332  6e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  40.54 
 
 		 453 aa  332  8e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3718  peptidase U32  41.74 
 
 		 442 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84223  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  39.91 
 
 		 465 aa  330  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  42.86 
 
 		 548 aa  330  3e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  42.78 
 
 		 471 aa  330  4e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  39.91 
 
 		 454 aa  330  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  39.91 
 
 		 454 aa  330  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  39.91 
 
 		 454 aa  329  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  40.05 
 
 		 455 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2456  peptidase U32  40.49 
 
 		 462 aa  329  6e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.181702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  40.05 
 
 		 455 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  40.14 
 
 		 447 aa  328  7e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  39.82 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  39.82 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  39.59 
 
 		 455 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  43.31 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2802  peptidase U32  39.82 
 
 		 455 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1363  regulatory protein, LacI  40.41 
 
 		 440 aa  327  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  40.37 
 
 		 454 aa  325  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2976  peptidase U32  40.58 
 
 		 453 aa  325  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.470288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  40.5 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4589  peptidase U32  41.71 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00540  Peptidase, U32 family  40.14 
 
 		 453 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.210117  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  39.46 
 
 		 464 aa  322  5e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  39.46 
 
 		 464 aa  322  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3011  peptidase U32  40.37 
 
 		 455 aa  322  5e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  39.46 
 
 		 464 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  42.02 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  40.14 
 
 		 453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  42.82 
 
 		 418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1194  peptidase U32  39.74 
 
 		 453 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  41.78 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1812  U32 family peptidase  39.82 
 
 		 476 aa  320  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3342  peptidase U32  39.05 
 
 		 461 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  41.61 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  39.78 
 
 		 453 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  43.55 
 
 		 435 aa  317  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2698  peptidase U32  41.93 
 
 		 453 aa  315  9e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1045  peptidase U32  38.53 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2321  peptidase, U32 family  41.2 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3532  peptidase U32  39.68 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71820  putative peptidase  40.59 
 
 		 464 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2372  peptidase, U32 family  41.2 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2278  peptidase, U32 family  41.2 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2365  peptidase, U32 family  41.2 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2481  peptidase, U32 family  41.2 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6230  putative peptidase  40.36 
 
 		 464 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.327372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>