267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6452 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 164 aa  340  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  48.5 
 
 		 170 aa  174  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 		 172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 		 170 aa  170  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  48.8 
 
 		 170 aa  170  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 172 aa  168  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 162 aa  168  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  47.31 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  48.15 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 		 169 aa  164  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  45.83 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  42.77 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 187 aa  160  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 174 aa  157  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 		 162 aa  157  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  44.64 
 
 		 171 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 171 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  46.31 
 
 		 160 aa  153  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  40.96 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 		 171 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  44.59 
 
 		 183 aa  152  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  48.41 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  44.97 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  43.12 
 
 		 161 aa  150  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  48.43 
 
 		 164 aa  151  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 177 aa  150  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 171 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  45.16 
 
 		 183 aa  150  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 167 aa  150  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 		 169 aa  150  7e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  40.24 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  42.01 
 
 		 171 aa  148  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  43.48 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  41.98 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  51.85 
 
 		 163 aa  147  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  46.98 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  41.36 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  44.16 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  42.5 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  47.89 
 
 		 195 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  41.98 
 
 		 161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  44.87 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  43.95 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  41.1 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  43.4 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  39.29 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  42.77 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 		 166 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  41.14 
 
 		 175 aa  140  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  46.38 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  43.12 
 
 		 167 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  42.5 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  47.1 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  45.14 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  42.51 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  46.38 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  40.49 
 
 		 167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  42.5 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  42.07 
 
 		 188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  45.65 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  40.74 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  45.07 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  45.07 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  42.5 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  43.12 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1503  dihydrofolate reductase  42.07 
 
 		 166 aa  137  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>