64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5066 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  40.93 
 
 
230 aa  171  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  39.18 
 
 
248 aa  168  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  39.18 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  34.54 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  37.89 
 
 
233 aa  142  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  34.2 
 
 
240 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  33.84 
 
 
238 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  31.82 
 
 
280 aa  131  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  32.47 
 
 
216 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  34.85 
 
 
243 aa  124  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  36.56 
 
 
231 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  34.32 
 
 
871 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  29.63 
 
 
197 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  33.33 
 
 
509 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  41.41 
 
 
167 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  35.06 
 
 
232 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  29.82 
 
 
207 aa  101  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  29.05 
 
 
261 aa  93.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  28.32 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  27.57 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  24.28 
 
 
424 aa  72.4  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  29.49 
 
 
274 aa  72  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  26.16 
 
 
447 aa  63.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30260  predicted protein  26.11 
 
 
235 aa  62.8  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804588  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  27.57 
 
 
249 aa  62  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  24.52 
 
 
275 aa  62  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  26.49 
 
 
1072 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2193  lipolytic protein G-D-S-L family  26.98 
 
 
252 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.689608  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  26.9 
 
 
479 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0670  GDSL family lipase  24.02 
 
 
226 aa  57.4  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  24.53 
 
 
262 aa  56.2  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04656  hypothetical protein  55.81 
 
 
48 aa  55.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15268  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  25.6 
 
 
244 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0022  lipolytic protein G-D-S-L family  27.23 
 
 
236 aa  55.1  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.954295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  27.22 
 
 
383 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2682  lipolytic protein G-D-S-L family  23.47 
 
 
593 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  21.02 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.33 
 
 
265 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  24.79 
 
 
648 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37185  predicted protein  20 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.098769  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0641  hypothetical protein  29.26 
 
 
246 aa  52.4  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.726256 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  24.6 
 
 
257 aa  52.4  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1343  lysophospholipase L1 or related esterase  27.15 
 
 
171 aa  52  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000279155  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3112  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.82 
 
 
287 aa  52.4  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  25.95 
 
 
152 aa  51.6  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  25.15 
 
 
260 aa  50.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  25.67 
 
 
593 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4395  lipolytic protein G-D-S-L family  25.68 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.750338  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  23.3 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0578  lipolytic protein G-D-S-L family  22.45 
 
 
228 aa  48.5  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.695462  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44063  predicted protein  23.03 
 
 
348 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213778  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  26.45 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  23.12 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0344  lipolytic protein G-D-S-L family  24.19 
 
 
243 aa  45.4  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00761179  normal  0.124029 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0744  lysophospholipase L1 related esterase  23.63 
 
 
180 aa  45.1  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  26.32 
 
 
277 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2205  G-D-S-L family lipolytic protein  23.33 
 
 
372 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0392417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2205  lipolytic protein G-D-S-L family  24.86 
 
 
241 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0428962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0721  hypothetical protein  22.63 
 
 
249 aa  42.4  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  23.75 
 
 
286 aa  42  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  25.14 
 
 
749 aa  42  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  23.75 
 
 
275 aa  42  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  25.12 
 
 
261 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>