More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3611 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  100 
 
 		 370 aa  760    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  70.65 
 
 		 370 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  68.92 
 
 		 372 aa  545  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  67.57 
 
 		 370 aa  531  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  67.66 
 
 		 374 aa  532  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  67.4 
 
 		 369 aa  518  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  66.85 
 
 		 369 aa  511  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  66.3 
 
 		 370 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  65.76 
 
 		 370 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  63.78 
 
 		 384 aa  493  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  63.24 
 
 		 366 aa  476  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 366 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  63.04 
 
 		 366 aa  474  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  63.04 
 
 		 366 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.5 
 
 		 366 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.23 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.23 
 
 		 366 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  62.47 
 
 		 367 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  62.23 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.23 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  62.47 
 
 		 367 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  62.23 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  62.23 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  62.23 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  61.41 
 
 		 367 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  61.41 
 
 		 367 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  60.27 
 
 		 371 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  58.92 
 
 		 367 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  58.11 
 
 		 369 aa  458  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  62.1 
 
 		 372 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  58.65 
 
 		 367 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  59.07 
 
 		 373 aa  454  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  60.05 
 
 		 367 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  59.07 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  60.38 
 
 		 364 aa  451  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  59.07 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  58.87 
 
 		 367 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  57.18 
 
 		 367 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  59.57 
 
 		 371 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  56.84 
 
 		 368 aa  440  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.99 
 
 		 369 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  59.35 
 
 		 380 aa  436  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  60.6 
 
 		 402 aa  432  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  59.08 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  58.71 
 
 		 370 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  56.64 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  55.98 
 
 		 366 aa  427  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  53.3 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  57.41 
 
 		 381 aa  425  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  57.99 
 
 		 369 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  57.74 
 
 		 378 aa  423  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  58.22 
 
 		 369 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.34 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  55.71 
 
 		 365 aa  418  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.61 
 
 		 360 aa  418  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  52 
 
 		 405 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  57.07 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  57.07 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.07 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  57.07 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  56.72 
 
 		 366 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  57.34 
 
 		 585 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  56.72 
 
 		 366 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  51.73 
 
 		 410 aa  411  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  55.41 
 
 		 364 aa  413  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.52 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  55.14 
 
 		 364 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.15 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  54.86 
 
 		 364 aa  409  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  51.36 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  55.79 
 
 		 377 aa  411  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  56.22 
 
 		 365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  55.31 
 
 		 364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  55.17 
 
 		 376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  56.4 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  50.25 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  53.49 
 
 		 380 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  53.39 
 
 		 402 aa  398  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  50 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  52.45 
 
 		 380 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  53.51 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  53.51 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  53.51 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  53.39 
 
 		 366 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  52.45 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  49.37 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  48.99 
 
 		 409 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  51.47 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.73 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  51.73 
 
 		 372 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.47 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  55.46 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  51.47 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  52.57 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  52.14 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  52.14 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  53.46 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  52.14 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>