More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2609 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  330  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1342  putative metalloprotease  41.21 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  43.67 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  43.15 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1990  putative metalloprotease  43.31 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2275  putative metalloprotease  42.68 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  41.21 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0778  metal-dependent hydrolase  43.43 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0231681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  40.85 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  44.88 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  41.67 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  41.51 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  40.67 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  44.52 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3596  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  43.84 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2662  hypothetical protein  38.37 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000113607  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  36 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  39.73 
 
 		 142 aa  104  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  39.53 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  42.47 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  39.87 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  37.67 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  42.86 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  42.47 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2482  putative metalloprotease  37.67 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  38.12 
 
 		 446 aa  102  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  40.41 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  38.96 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1028  protein of unknown function UPF0054  34.67 
 
 		 153 aa  97.8  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1944  protein of unknown function UPF0054  39.86 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  35.85 
 
 		 301 aa  95.1  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  39.73 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  39.73 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0987  metal-dependent hydrolase  36.76 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2782  putative metalloprotease  39.2 
 
 		 176 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  36.73 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  38.36 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  37.3 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  36.62 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4995  hypothetical protein  39.07 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2713  protein of unknown function UPF0054  38.4 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.06 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  34.16 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5027  putative metalloprotease  37.4 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  39.34 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 189 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  39.1 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  40.34 
 
 		 155 aa  84.3  6e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  38.35 
 
 		 161 aa  84  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  38.71 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1814  hypothetical protein  36.89 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.28628  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  33.1 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  37.32 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0136  protein of unknown function UPF0054  35.51 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  37.32 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  30.38 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4494  protein of unknown function UPF0054  33.74 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  30.38 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44068  predicted protein  39.67 
 
 		 411 aa  81.3  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00247631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  33.76 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  33.76 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  33.76 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  35.92 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  38.17 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  36.49 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  34.18 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  34.65 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1642  protein of unknown function UPF0054  34.64 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0208313  hitchhiker  0.00194767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  33.13 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0402  putative metalloprotease  36.8 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  35.17 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1328  protein of unknown function UPF0054  33.33 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000414837  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  33.54 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  34.16 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  36.57 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2370  hypothetical protein  36.55 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  28.74 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1273  hypothetical protein  39.25 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.263066  normal  0.458377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  33.97 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  32.69 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1058  protein of unknown function UPF0054  34.59 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  36.28 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  31.65 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  34.78 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2719  hypothetical protein  33.05 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294545  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  34 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  34.15 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  30.65 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  30.22 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  34.65 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2034  hypothetical protein  34.96 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  31.52 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  28.93 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  30.61 
 
 		 190 aa  73.9  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>