More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1966 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1966  methyltransferase type 11  100 
 
 
215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000755977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.78 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  31.11 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  24.31 
 
 
663 aa  68.9  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  30.58 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
247 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  32 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.8 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  28.24 
 
 
637 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 
382 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  29.63 
 
 
249 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  38.61 
 
 
282 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  29.63 
 
 
249 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  29.63 
 
 
249 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  29.63 
 
 
249 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.33 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  29.63 
 
 
249 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  29.63 
 
 
249 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.96 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  29.63 
 
 
249 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1648  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.53805  normal  0.884834 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  26.71 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  28.7 
 
 
249 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  28.7 
 
 
249 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6192  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
254 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 
234 aa  58.2  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09363  putative methyltransferase  28.99 
 
 
227 aa  58.2  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.182013  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  33.98 
 
 
276 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
261 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  39.24 
 
 
280 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  32.84 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf339  predicted O-methyltransferase  27.51 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00322712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  27.73 
 
 
244 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  24.32 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  34.13 
 
 
191 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0660  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
303 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  25.47 
 
 
226 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  30.4 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
266 aa  55.8  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  25.47 
 
 
226 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  26.55 
 
 
262 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  30.23 
 
 
310 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  29.71 
 
 
304 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  26.47 
 
 
226 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.06 
 
 
241 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  25.47 
 
 
236 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.05 
 
 
230 aa  55.1  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  29.88 
 
 
273 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
417 aa  55.5  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
280 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  25.99 
 
 
270 aa  55.1  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  30.58 
 
 
541 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.53 
 
 
310 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  30.58 
 
 
541 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  24.84 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  29.82 
 
 
296 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.51 
 
 
252 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  28.37 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  24.84 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  34.18 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  30.58 
 
 
541 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  30.53 
 
 
310 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  24.22 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.43 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  24.84 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  24.84 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.28 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0424  methyltransferase type 11  30.39 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.111322  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.16 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  24.84 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.05 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
328 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  40 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  30.58 
 
 
541 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  29.29 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  26.83 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  34.29 
 
 
258 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
243 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
265 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  25.74 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 
284 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1779  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.3 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.3 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0585  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  27.52 
 
 
243 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 
276 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>