223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1365 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  38.55 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  37.35 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  37.35 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  36.75 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  36.59 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  36.59 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  36.14 
 
 		 173 aa  97.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  36.59 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  35.98 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  35.54 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.14 
 
 		 188 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.32 
 
 		 178 aa  90.5  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.94 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  33.52 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  33.52 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  31.89 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  31.32 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  31.25 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  30.22 
 
 		 199 aa  85.1  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  36.71 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.58 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  29.83 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.34 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  29.03 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  29.78 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.46 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.32 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.74 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  27.53 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  32.65 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  25.56 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  33.12 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  34.23 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  28.49 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  29.94 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  27.72 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  27.38 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.58 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.9 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.42 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.66 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.22 
 
 		 390 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  27.74 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.89 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.79 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.56 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  30.46 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  27.74 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  27.33 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  27.33 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.34 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  29.94 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.57 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  24.59 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  26.84 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  28.21 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.23 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  25.88 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  26.25 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.13 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.48 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  28.28 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.82 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.82 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  29.25 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  27.72 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.26 
 
 		 199 aa  60.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  28.65 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  25.85 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.29 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.15 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5564  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.68 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  31.29 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.32 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3848  dihydrofolate reductase family protein  27.23 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347395  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.94 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  26.21 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.39 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  30.67 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  25.79 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  25.93 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  27.75 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  25.64 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  25.68 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  30.67 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.06 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.14 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  30.14 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.92 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>