More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1021 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  100 
 
 
209 aa  424  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  50.51 
 
 
215 aa  191  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  43.81 
 
 
219 aa  181  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  42.08 
 
 
218 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  44.39 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  48.74 
 
 
220 aa  178  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  45.11 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  40.39 
 
 
216 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  41.95 
 
 
214 aa  167  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  41.18 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  41.06 
 
 
215 aa  164  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  40.59 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  43.39 
 
 
219 aa  161  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  40.98 
 
 
219 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  37.62 
 
 
230 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  35.96 
 
 
228 aa  149  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  34.78 
 
 
223 aa  149  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  35.27 
 
 
223 aa  149  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  37.82 
 
 
220 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  38.81 
 
 
219 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  36.79 
 
 
208 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  41.88 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  41.67 
 
 
978 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  37.44 
 
 
965 aa  138  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  34.15 
 
 
233 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  35.83 
 
 
986 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  36.17 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  32.81 
 
 
219 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  32.81 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  32.81 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  32.81 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  32.81 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  33.33 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  32.81 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  32.81 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  34.21 
 
 
585 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  37 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  31.34 
 
 
221 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  33.33 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  37.77 
 
 
456 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  36.7 
 
 
456 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  36.7 
 
 
456 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.22 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
216 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  32.98 
 
 
216 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.89 
 
 
525 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.91 
 
 
225 aa  98.2  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.37 
 
 
233 aa  94  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0340  HAD superfamily hydrolase  30.37 
 
 
216 aa  92.4  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.369886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  30.51 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  30.51 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  30.51 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  33.16 
 
 
221 aa  92.4  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  29.44 
 
 
211 aa  91.7  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.91 
 
 
260 aa  91.3  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  31.8 
 
 
212 aa  91.3  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  28.37 
 
 
248 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.38 
 
 
1051 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.97 
 
 
238 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.34 
 
 
257 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.85 
 
 
228 aa  89.4  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.81 
 
 
1053 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.95 
 
 
1055 aa  88.6  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
238 aa  88.6  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.2 
 
 
236 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.7 
 
 
1051 aa  88.2  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  26.7 
 
 
188 aa  88.2  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.38 
 
 
218 aa  88.2  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.19 
 
 
250 aa  87.8  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.38 
 
 
1053 aa  87.8  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.05 
 
 
246 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.85 
 
 
226 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  30.16 
 
 
220 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.69 
 
 
258 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  28.37 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  26.49 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  28.11 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.16 
 
 
262 aa  85.9  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.5 
 
 
1314 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.08 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.85 
 
 
232 aa  85.5  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  34.18 
 
 
242 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.82 
 
 
240 aa  85.1  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  28.57 
 
 
194 aa  84.7  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.26 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  30.65 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.02 
 
 
212 aa  84  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.84 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  29.36 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.75 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  26.84 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  30.65 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.85 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  30.65 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  28.88 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  30.65 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.78 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>