More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0863 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  100 
 
 		 599 aa  1224    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  24.96 
 
 		 617 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 585 aa  172  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  36.68 
 
 		 597 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  30.23 
 
 		 627 aa  167  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  31.67 
 
 		 583 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  31.67 
 
 		 583 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  30 
 
 		 488 aa  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  34.85 
 
 		 578 aa  150  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  32.66 
 
 		 600 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  34.47 
 
 		 578 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  36.48 
 
 		 569 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 576 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  31.27 
 
 		 595 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  32.16 
 
 		 604 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  28.43 
 
 		 603 aa  144  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  31.91 
 
 		 516 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  36.62 
 
 		 414 aa  140  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0292  signal transduction histidine kinase, LytS  38.94 
 
 		 506 aa  140  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  31.14 
 
 		 577 aa  140  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  32.09 
 
 		 600 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  27.19 
 
 		 498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  30.63 
 
 		 597 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  25.93 
 
 		 596 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 580 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  25.87 
 
 		 623 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  31.37 
 
 		 604 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  23.66 
 
 		 587 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  29.77 
 
 		 612 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  28.21 
 
 		 603 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 502 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  31.65 
 
 		 568 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  29.79 
 
 		 610 aa  124  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  29.67 
 
 		 594 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  33.19 
 
 		 600 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2405  sensor histidine kinase  25.23 
 
 		 512 aa  121  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 640 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  32.91 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  30.77 
 
 		 607 aa  120  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 561 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 561 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 561 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 561 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 561 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0208  histidine kinase internal region  25.27 
 
 		 518 aa  117  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0214  histidine kinase internal region  25.27 
 
 		 518 aa  117  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  26.39 
 
 		 564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  27.76 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  30.9 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  32.49 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1250  signal transduction histidine kinase, LytS  28.47 
 
 		 574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.888178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  28.52 
 
 		 594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  30.9 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3033  histidine kinase internal region  28.42 
 
 		 633 aa  115  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0284117  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  27.47 
 
 		 565 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1549  signal transduction histidine kinase, LytS  32.56 
 
 		 560 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3857  signal transduction histidine kinase, LytS  27.46 
 
 		 581 aa  114  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000136608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 483 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 558 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  27.47 
 
 		 565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  30.27 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  29.02 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 561 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  30.33 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  27.39 
 
 		 567 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  27.47 
 
 		 565 aa  111  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  27.93 
 
 		 561 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1721  histidine kinase internal region  31.14 
 
 		 573 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  27.93 
 
 		 561 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  27.93 
 
 		 561 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 561 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  30.38 
 
 		 446 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  27.93 
 
 		 561 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 561 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  27.93 
 
 		 561 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  29.2 
 
 		 495 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 410 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  28.95 
 
 		 561 aa  110  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  30.34 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  31.16 
 
 		 560 aa  108  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  29.17 
 
 		 565 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1659  signal transduction histidine kinase, LytS  30.23 
 
 		 565 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000213246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2684  signal transduction histidine kinase, LytS  30.23 
 
 		 565 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.287497  hitchhiker  0.00116896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1696  signal transduction histidine kinase, LytS  30.23 
 
 		 565 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0311025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  30.89 
 
 		 391 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  29.75 
 
 		 455 aa  107  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  31.38 
 
 		 411 aa  107  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2822  sensor histidine kinase  30.7 
 
 		 560 aa  107  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  30.5 
 
 		 335 aa  107  9e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 410 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2431  signal transduction histidine kinase, LytS  30.23 
 
 		 560 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000324417  normal  0.0100076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  30.23 
 
 		 560 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  27.78 
 
 		 561 aa  106  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  26.34 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  28.64 
 
 		 576 aa  105  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1674  signal transduction histidine kinase, LytS  30.33 
 
 		 565 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0178726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  29.49 
 
 		 393 aa  105  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  28.64 
 
 		 450 aa  103  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1393  histidine kinase internal region  32.28 
 
 		 586 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>