33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1680 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  57.68 
 
 
1168 aa  1400    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  100 
 
 
1203 aa  2491    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  73.16 
 
 
1193 aa  1817    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  63.54 
 
 
1201 aa  1522    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  34.33 
 
 
1180 aa  624  1e-177  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  34.41 
 
 
1192 aa  521  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  30.44 
 
 
1202 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  29.89 
 
 
1185 aa  498  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  30.19 
 
 
1203 aa  489  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  31.94 
 
 
1213 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  30.7 
 
 
1178 aa  434  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  27.69 
 
 
1183 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  25.31 
 
 
1186 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  23.75 
 
 
1177 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  26.95 
 
 
1214 aa  189  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  25.99 
 
 
1228 aa  178  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  24.2 
 
 
1211 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  23.63 
 
 
1206 aa  126  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  26.12 
 
 
1142 aa  119  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  25.62 
 
 
1145 aa  106  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  21.48 
 
 
1207 aa  105  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  21.48 
 
 
1153 aa  104  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  25.87 
 
 
1236 aa  102  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  21.34 
 
 
1207 aa  102  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  23.48 
 
 
1239 aa  101  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  23.73 
 
 
1199 aa  96.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  22.7 
 
 
1208 aa  95.9  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  21.34 
 
 
1148 aa  94.7  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  26.35 
 
 
1157 aa  90.1  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1083  hypothetical protein  22.03 
 
 
1166 aa  84.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.679898  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1708  hypothetical protein  26.7 
 
 
1157 aa  84  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0961451 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1911  hypothetical protein  22.01 
 
 
1280 aa  76.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281193  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3194  hypothetical protein  19.78 
 
 
1270 aa  58.9  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>