More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1532 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1532  electron transport complex RsxE subunit  100 
 
 		 201 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0221423  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1313  electron transport complex RsxE subunit  90 
 
 		 200 aa  359  1e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.860019  normal  0.240269 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1158  electron transport complex RsxE subunit  80.81 
 
 		 200 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.252127 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0985  electron transport complex RsxE subunit  83.33 
 
 		 201 aa  320  7e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0082  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  56.54 
 
 		 216 aa  218  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0420224  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0307  electron transport complex RsxE subunit  54.59 
 
 		 196 aa  215  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0260  electron transport complex RsxE subunit  56.32 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0214  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  53.88 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000178696  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14320  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  55.1 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000437194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2433  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  54.79 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0685  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  56.28 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.360116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1084  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  54.08 
 
 		 205 aa  201  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0652551 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0696  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  52.97 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.682533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0497  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  51.78 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000269706  hitchhiker  0.000180019 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0345  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  57.46 
 
 		 239 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0390  electron transport complex RsxE subunit  55.62 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2970  electron transport complex RsxE subunit  50.48 
 
 		 232 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0677  electron transport complex RsxE subunit  52.97 
 
 		 200 aa  194  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0701  electron transport complex RsxE subunit  52.97 
 
 		 200 aa  194  6e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.647588  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1574  electron transport complex RsxE subunit  56.35 
 
 		 204 aa  191  8e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0333623  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1957  electron transport complex RsxE subunit  50.75 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1319  electron transport complex RsxE subunit  50.26 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.175799  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1540  electron transport complex RsxE subunit  49.28 
 
 		 255 aa  185  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02734  NADH-ubiquinone oxidoreductase  49.54 
 
 		 230 aa  184  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1241  electron transport complex RsxE subunit  52.41 
 
 		 225 aa  184  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0613  electron transport complex RsxE subunit  56.45 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2827  electron transport complex RsxE subunit  53.12 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1064  electron transport complex RsxE subunit  46.83 
 
 		 218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0737938  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0835  electron transport complex RsxE subunit  48.47 
 
 		 219 aa  181  9.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0472415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2358  electron transport complex RsxE subunit  47.2 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2248  electron transport complex RsxE subunit  45.33 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000887941  normal  0.482499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1900  electron transport complex RsxE subunit  45.33 
 
 		 233 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000164726  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1867  electron transport complex RsxE subunit  47.37 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1835  electron transport complex RsxE subunit  47.2 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.521191  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2513  electron transport complex RsxE subunit  47.66 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2020  electron transport complex RsxE subunit  45.12 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1324  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  48.69 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2039  electron transport complex RsxE subunit  48.13 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2264  electron transport complex RsxE subunit  47.2 
 
 		 232 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000442718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2177  electron transport complex RsxE subunit  49.52 
 
 		 231 aa  178  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.206237  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4550  electron transport complex RsxE subunit  47.2 
 
 		 232 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2012  electron transport complex RsxE subunit  44.86 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00017811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1868  electron transport complex RsxE subunit  46.26 
 
 		 231 aa  177  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0062  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  50.26 
 
 		 219 aa  177  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2071  electron transport complex RsxE subunit  46.73 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2278  electron transport complex RsxE subunit  46.73 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316323  normal  0.959617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2561  electron transport complex RsxE subunit  47.42 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.428281  normal  0.0236645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2060  electron transport complex RsxE subunit  46.73 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000214893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2107  electron transport complex RsxE subunit  46.73 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1381  electron transport complex RsxE subunit  46.94 
 
 		 203 aa  175  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1031  electron transport complex RsxE subunit  45.97 
 
 		 243 aa  175  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000559383  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0519  electron transport complex RsxE subunit  46.27 
 
 		 223 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2069  electron transport complex RsxE subunit  47.2 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00102029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1906  electron transport complex RsxE subunit  47.2 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2173  electron transport complex RsxE subunit  47.2 
 
 		 232 aa  175  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.303807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1845  electron transport complex RsxE subunit  45.79 
 
 		 232 aa  174  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000056167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2320  electron transport complex RsxE subunit  45.97 
 
 		 235 aa  174  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0933  electron transport complex RsxE subunit  44.98 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2194  electron transport complex RsxE subunit  46.83 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0733  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.67 
 
 		 230 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0533  electron transport complex RsxE subunit  44.86 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000076694  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1921  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.63 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2159  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  43.26 
 
 		 230 aa  171  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0584  electron transport complex RsxE subunit  45.36 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2819  electron transport complex RsxE subunit  44.19 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002944  electron transport complex protein RnfE  44.86 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0179212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  48.76 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.221672  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2898  electron transport complex RsxE subunit  48.24 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.594329  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2235  electron transport complex RsxE subunit  43.93 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02969  electron transport complex RsxE subunit  44.39 
 
 		 230 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3197  electron transport complex RsxE subunit  45.83 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0099576  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3936  electron transport complex RsxE subunit  45.83 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000255424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2020  electron transport complex RsxE subunit  43.46 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0288  electron transport complex RsxE subunit  47.06 
 
 		 231 aa  157  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3197  electron transport complex RsxE subunit  47.09 
 
 		 244 aa  157  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.113387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2631  electron transport complex RsxE subunit  43.33 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.854749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2405  electron transport complex RsxE subunit  45.71 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.561649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19220  electron transport complex RsxE subunit  41.95 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0811  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  48.53 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.586167  normal  0.660499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1399  electron transport complex RsxE subunit  41.35 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1624  electron transport complex RsxE subunit  43.12 
 
 		 230 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  normal  0.350823 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0531  RnfA-Nqr electron transport subunit  41.79 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1888  electron transport complex RsxE subunit  43.12 
 
 		 230 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1795  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  43.46 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  hitchhiker  0.000244527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1720  electron transport complex RsxE subunit  43.12 
 
 		 230 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208116  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1564  electron transport complex RsxE subunit  44.39 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.257712  normal  0.0772811 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1552  electron transport complex RsxE subunit  43.12 
 
 		 230 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18890  electron transport complex RsxE subunit  42.31 
 
 		 238 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0559311  normal  0.0454317 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0723  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.85 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50930  Electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  43.54 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1170  electron transport complex RsxE subunit  47.06 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3237  electron transport complex RsxE subunit  42.23 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0309  RnfA-Nqr electron transport subunit  41.75 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00114498  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0548  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  42.45 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.614250000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1841  electron transport complex RsxE subunit  42.66 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000217086  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1821  electron transport complex RsxE subunit  42.66 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8848  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1567  electron transport complex RsxE subunit  42.66 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.276457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2344  electron transport complex RsxE subunit  42.66 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00490465  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2009  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  43.46 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1997  electron transport complex RsxE subunit  43.46 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal  0.141925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>