More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2433 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2433  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  100 
 
 
218 aa  431  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109684  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0345  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  51.93 
 
 
239 aa  236  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0082  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  58.85 
 
 
216 aa  229  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0420224  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1158  electron transport complex RsxE subunit  58.46 
 
 
200 aa  226  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.252127 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1957  electron transport complex RsxE subunit  56.4 
 
 
239 aa  223  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0307  electron transport complex RsxE subunit  59.79 
 
 
196 aa  222  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1241  electron transport complex RsxE subunit  55.34 
 
 
225 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1319  electron transport complex RsxE subunit  52.94 
 
 
222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.175799  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0260  electron transport complex RsxE subunit  55.61 
 
 
202 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0214  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  50.9 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000178696  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1313  electron transport complex RsxE subunit  55.26 
 
 
200 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.860019  normal  0.240269 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0696  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  49.32 
 
 
235 aa  211  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.682533  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0985  electron transport complex RsxE subunit  58.95 
 
 
201 aa  209  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14320  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  56.08 
 
 
199 aa  206  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000437194  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1532  electron transport complex RsxE subunit  54.79 
 
 
201 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0221423  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0701  electron transport complex RsxE subunit  54 
 
 
200 aa  205  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.647588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0677  electron transport complex RsxE subunit  53.5 
 
 
200 aa  204  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0390  electron transport complex RsxE subunit  56.06 
 
 
217 aa  203  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0519  electron transport complex RsxE subunit  48.62 
 
 
223 aa  202  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1324  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  53.65 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0584  electron transport complex RsxE subunit  49.53 
 
 
224 aa  198  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1084  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  50.51 
 
 
205 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0652551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0497  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  49.01 
 
 
206 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000269706  hitchhiker  0.000180019 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2827  electron transport complex RsxE subunit  53.61 
 
 
200 aa  191  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1381  electron transport complex RsxE subunit  49.26 
 
 
203 aa  187  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108717  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0685  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  48.7 
 
 
222 aa  187  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.360116  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1574  electron transport complex RsxE subunit  52.55 
 
 
204 aa  186  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0333623  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0531  RnfA-Nqr electron transport subunit  49.74 
 
 
203 aa  185  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0613  electron transport complex RsxE subunit  53.57 
 
 
206 aa  184  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0548  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  43.38 
 
 
219 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.614250000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0835  electron transport complex RsxE subunit  44.86 
 
 
219 aa  176  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0472415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0062  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  47.06 
 
 
219 aa  175  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1845  electron transport complex RsxE subunit  43.19 
 
 
232 aa  175  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000056167  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02734  NADH-ubiquinone oxidoreductase  46.41 
 
 
230 aa  174  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1867  electron transport complex RsxE subunit  45.54 
 
 
228 aa  174  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2159  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  44.23 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2970  electron transport complex RsxE subunit  44.04 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1921  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  42.29 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2278  electron transport complex RsxE subunit  43.19 
 
 
232 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316323  normal  0.959617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2071  electron transport complex RsxE subunit  43.87 
 
 
232 aa  171  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2513  electron transport complex RsxE subunit  44.6 
 
 
232 aa  172  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2060  electron transport complex RsxE subunit  43.19 
 
 
232 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000214893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2107  electron transport complex RsxE subunit  43.19 
 
 
232 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257161  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1064  electron transport complex RsxE subunit  46.27 
 
 
218 aa  172  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0737938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2069  electron transport complex RsxE subunit  42.66 
 
 
232 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00102029  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1906  electron transport complex RsxE subunit  42.66 
 
 
232 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2173  electron transport complex RsxE subunit  43.19 
 
 
232 aa  171  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.303807  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4550  electron transport complex RsxE subunit  42.53 
 
 
232 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2264  electron transport complex RsxE subunit  42.53 
 
 
232 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000442718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2358  electron transport complex RsxE subunit  45.19 
 
 
231 aa  171  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2994  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  47.44 
 
 
226 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2020  electron transport complex RsxE subunit  43.81 
 
 
235 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0288  electron transport complex RsxE subunit  44.29 
 
 
231 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1868  electron transport complex RsxE subunit  44.02 
 
 
231 aa  169  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2177  electron transport complex RsxE subunit  44.02 
 
 
231 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.206237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2320  electron transport complex RsxE subunit  45.1 
 
 
235 aa  168  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1835  electron transport complex RsxE subunit  44.39 
 
 
232 aa  168  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.521191  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0533  electron transport complex RsxE subunit  46.53 
 
 
230 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000076694  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  47.96 
 
 
199 aa  167  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.221672  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0933  electron transport complex RsxE subunit  42.2 
 
 
238 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1031  electron transport complex RsxE subunit  43.41 
 
 
243 aa  166  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000559383  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2012  electron transport complex RsxE subunit  40.09 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00017811  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02969  electron transport complex RsxE subunit  43.54 
 
 
230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1900  electron transport complex RsxE subunit  40 
 
 
233 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000164726  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2039  electron transport complex RsxE subunit  42.52 
 
 
236 aa  164  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0309  RnfA-Nqr electron transport subunit  42.41 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00114498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2561  electron transport complex RsxE subunit  42.25 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.428281  normal  0.0236645 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1572  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  43.08 
 
 
224 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2248  electron transport complex RsxE subunit  40 
 
 
233 aa  162  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000887941  normal  0.482499 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1540  electron transport complex RsxE subunit  40.87 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002944  electron transport complex protein RnfE  43.54 
 
 
230 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0179212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3237  electron transport complex RsxE subunit  40.72 
 
 
239 aa  161  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2819  electron transport complex RsxE subunit  42.58 
 
 
228 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2194  electron transport complex RsxE subunit  44.02 
 
 
263 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2235  electron transport complex RsxE subunit  40.44 
 
 
232 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3197  electron transport complex RsxE subunit  44.39 
 
 
244 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0099576  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3936  electron transport complex RsxE subunit  44.39 
 
 
244 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000255424  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2135  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit D  43.35 
 
 
209 aa  157  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000295716  normal  0.896446 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1881  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  42.21 
 
 
210 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00240188  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0943  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  41.58 
 
 
210 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00397597  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1816  electron transport complex RsxE subunit  44.5 
 
 
228 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0219521  decreased coverage  0.000344211 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03272  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  41.71 
 
 
210 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1720  electron transport complex RsxE subunit  42.17 
 
 
230 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208116  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1552  electron transport complex RsxE subunit  42.17 
 
 
230 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1106  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  41.58 
 
 
210 aa  155  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1624  electron transport complex RsxE subunit  42.17 
 
 
230 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  normal  0.350823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1564  electron transport complex RsxE subunit  42.17 
 
 
230 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.257712  normal  0.0772811 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0733  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  42.51 
 
 
230 aa  155  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22975  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0939  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  41.58 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0695822  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0977  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  41.58 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.274009  normal  0.954509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0941  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  41.58 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3435  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  41.58 
 
 
210 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0202767  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0927  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  41.58 
 
 
210 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0869068  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3560  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  41.58 
 
 
210 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0385705  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3363  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  41.58 
 
 
210 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0981921  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1841  electron transport complex RsxE subunit  42.61 
 
 
231 aa  154  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000217086  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1821  electron transport complex RsxE subunit  42.61 
 
 
231 aa  154  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2344  electron transport complex RsxE subunit  42.61 
 
 
231 aa  154  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00490465  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1888  electron transport complex RsxE subunit  42.17 
 
 
230 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3197  electron transport complex RsxE subunit  43.63 
 
 
244 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.113387  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>