More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_14320 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_14320  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  100 
 
 
199 aa  393  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000437194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0082  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  56.12 
 
 
216 aa  222  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0420224  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1158  electron transport complex RsxE subunit  54.45 
 
 
200 aa  212  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.252127 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1532  electron transport complex RsxE subunit  55.1 
 
 
201 aa  210  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0221423  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0260  electron transport complex RsxE subunit  55.61 
 
 
202 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0497  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  54.31 
 
 
206 aa  208  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000269706  hitchhiker  0.000180019 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1313  electron transport complex RsxE subunit  55.5 
 
 
200 aa  208  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.860019  normal  0.240269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0985  electron transport complex RsxE subunit  57.53 
 
 
201 aa  208  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2433  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  56.08 
 
 
218 aa  206  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1084  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  54.31 
 
 
205 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0652551 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0584  electron transport complex RsxE subunit  52.88 
 
 
224 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2827  electron transport complex RsxE subunit  53.61 
 
 
200 aa  201  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0062  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  51.79 
 
 
219 aa  200  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1319  electron transport complex RsxE subunit  49.25 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.175799  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0519  electron transport complex RsxE subunit  52.88 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1241  electron transport complex RsxE subunit  53.19 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1957  electron transport complex RsxE subunit  52.88 
 
 
239 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0307  electron transport complex RsxE subunit  50.79 
 
 
196 aa  188  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0696  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  49.73 
 
 
235 aa  187  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.682533  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0345  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  48.9 
 
 
239 aa  186  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0214  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  50.27 
 
 
253 aa  186  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000178696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0701  electron transport complex RsxE subunit  50.25 
 
 
200 aa  184  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.647588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0677  electron transport complex RsxE subunit  49.75 
 
 
200 aa  184  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0531  RnfA-Nqr electron transport subunit  49.74 
 
 
203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0685  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  52.2 
 
 
222 aa  182  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.360116  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1381  electron transport complex RsxE subunit  47 
 
 
203 aa  179  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108717  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0390  electron transport complex RsxE subunit  51.15 
 
 
217 aa  174  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1574  electron transport complex RsxE subunit  50.25 
 
 
204 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0333623  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0613  electron transport complex RsxE subunit  54.5 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0835  electron transport complex RsxE subunit  44.62 
 
 
219 aa  169  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0472415  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0548  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.33 
 
 
219 aa  167  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.614250000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1031  electron transport complex RsxE subunit  44.22 
 
 
243 aa  165  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000559383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2194  electron transport complex RsxE subunit  45.32 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2970  electron transport complex RsxE subunit  42.71 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1064  electron transport complex RsxE subunit  42.79 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0737938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1324  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  44.74 
 
 
215 aa  161  7e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  42.41 
 
 
199 aa  161  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.221672  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2819  electron transport complex RsxE subunit  43.48 
 
 
228 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2159  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  40.28 
 
 
230 aa  157  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3197  electron transport complex RsxE subunit  42.72 
 
 
244 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.113387  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2994  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  47.89 
 
 
226 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2631  electron transport complex RsxE subunit  41.18 
 
 
228 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.854749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02734  NADH-ubiquinone oxidoreductase  43.72 
 
 
230 aa  155  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0288  electron transport complex RsxE subunit  44.72 
 
 
231 aa  155  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0933  electron transport complex RsxE subunit  42.86 
 
 
238 aa  155  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2177  electron transport complex RsxE subunit  42.08 
 
 
231 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.206237  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0309  RnfA-Nqr electron transport subunit  39.9 
 
 
207 aa  154  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00114498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2358  electron transport complex RsxE subunit  42.65 
 
 
231 aa  154  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2012  electron transport complex RsxE subunit  41.54 
 
 
233 aa  154  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00017811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2248  electron transport complex RsxE subunit  41.88 
 
 
233 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000887941  normal  0.482499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1900  electron transport complex RsxE subunit  41.88 
 
 
233 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000164726  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1867  electron transport complex RsxE subunit  41.67 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2320  electron transport complex RsxE subunit  41.29 
 
 
235 aa  151  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2020  electron transport complex RsxE subunit  42.27 
 
 
235 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2978  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  41.41 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2278  electron transport complex RsxE subunit  41.71 
 
 
232 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316323  normal  0.959617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2107  electron transport complex RsxE subunit  41.71 
 
 
232 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257161  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4550  electron transport complex RsxE subunit  41.71 
 
 
232 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2264  electron transport complex RsxE subunit  41.71 
 
 
232 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000442718  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2060  electron transport complex RsxE subunit  41.71 
 
 
232 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000214893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3237  electron transport complex RsxE subunit  40 
 
 
239 aa  150  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205198  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0733  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  42.21 
 
 
230 aa  150  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22975  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1921  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  42.13 
 
 
231 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1540  electron transport complex RsxE subunit  39.9 
 
 
255 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1835  electron transport complex RsxE subunit  41.21 
 
 
232 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.521191  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1845  electron transport complex RsxE subunit  41.21 
 
 
232 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000056167  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2069  electron transport complex RsxE subunit  41.21 
 
 
232 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00102029  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1906  electron transport complex RsxE subunit  41.21 
 
 
232 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2173  electron transport complex RsxE subunit  41.21 
 
 
232 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.303807  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2235  electron transport complex RsxE subunit  40.3 
 
 
232 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3197  electron transport complex RsxE subunit  41.26 
 
 
244 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0099576  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3936  electron transport complex RsxE subunit  41.26 
 
 
244 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000255424  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1868  electron transport complex RsxE subunit  41.92 
 
 
231 aa  148  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2513  electron transport complex RsxE subunit  41.21 
 
 
232 aa  148  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1795  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  40 
 
 
230 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  hitchhiker  0.000244527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2071  electron transport complex RsxE subunit  40.7 
 
 
232 aa  147  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2898  electron transport complex RsxE subunit  41.09 
 
 
233 aa  147  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.594329  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2696  electron transport complex RsxE subunit  39.9 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002944  electron transport complex protein RnfE  39.7 
 
 
230 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0179212  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2539  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit D  40 
 
 
205 aa  144  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2561  electron transport complex RsxE subunit  41 
 
 
232 aa  144  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.428281  normal  0.0236645 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3579  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  40.93 
 
 
207 aa  144  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.908762  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2039  electron transport complex RsxE subunit  41.5 
 
 
236 aa  143  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0533  electron transport complex RsxE subunit  39.5 
 
 
230 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000076694  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2020  electron transport complex RsxE subunit  40.7 
 
 
225 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.644587  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0852  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  40.61 
 
 
206 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.249249  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1490  electron transport complex RsxE subunit  41.33 
 
 
224 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50930  Electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  41.9 
 
 
238 aa  141  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0751  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  39.59 
 
 
206 aa  141  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3375  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  39.59 
 
 
206 aa  141  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0064  RnfA-Nqr electron transport subunit  41.76 
 
 
203 aa  140  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3402  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  41.27 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1576  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  41.33 
 
 
207 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0905  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  39.59 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3561  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  39.59 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0757  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  39.59 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.451525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3492  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  39.59 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3269  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  39.59 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.616801  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3682  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  39.59 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.686863  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0650  RnfA-Nqr electron transport subunit  41.18 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.338076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>