More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1957 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1957  electron transport complex RsxE subunit  100 
 
 		 239 aa  477  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0519  electron transport complex RsxE subunit  73.09 
 
 		 223 aa  334  7e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0584  electron transport complex RsxE subunit  73.52 
 
 		 224 aa  319  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1241  electron transport complex RsxE subunit  76.26 
 
 		 225 aa  307  8e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2827  electron transport complex RsxE subunit  65.31 
 
 		 200 aa  252  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0531  RnfA-Nqr electron transport subunit  57.21 
 
 		 203 aa  229  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2433  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  56.4 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0260  electron transport complex RsxE subunit  52.79 
 
 		 202 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0082  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  54.08 
 
 		 216 aa  201  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0420224  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1319  electron transport complex RsxE subunit  45.66 
 
 		 222 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.175799  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0677  electron transport complex RsxE subunit  51.01 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0701  electron transport complex RsxE subunit  51.01 
 
 		 200 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.647588  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0390  electron transport complex RsxE subunit  53.93 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14320  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  52.88 
 
 		 199 aa  194  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000437194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0214  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  44.92 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000178696  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1158  electron transport complex RsxE subunit  51.96 
 
 		 200 aa  189  4e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.252127 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1574  electron transport complex RsxE subunit  51.28 
 
 		 204 aa  188  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0333623  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0345  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  47.01 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0497  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  52.33 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000269706  hitchhiker  0.000180019 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1532  electron transport complex RsxE subunit  50.75 
 
 		 201 aa  186  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0221423  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0613  electron transport complex RsxE subunit  51.31 
 
 		 206 aa  186  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0696  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  44 
 
 		 235 aa  185  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.682533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0933  electron transport complex RsxE subunit  49.53 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1084  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  50.26 
 
 		 205 aa  181  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0652551 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1867  electron transport complex RsxE subunit  47.91 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1313  electron transport complex RsxE subunit  50 
 
 		 200 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.860019  normal  0.240269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0985  electron transport complex RsxE subunit  53.96 
 
 		 201 aa  180  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0307  electron transport complex RsxE subunit  49.74 
 
 		 196 aa  179  4.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2060  electron transport complex RsxE subunit  48.78 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000214893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2107  electron transport complex RsxE subunit  48.78 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2278  electron transport complex RsxE subunit  48.78 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316323  normal  0.959617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2970  electron transport complex RsxE subunit  46.15 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2264  electron transport complex RsxE subunit  48.78 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000442718  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4550  electron transport complex RsxE subunit  48.78 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2513  electron transport complex RsxE subunit  48.78 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1845  electron transport complex RsxE subunit  48.99 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000056167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1540  electron transport complex RsxE subunit  46.08 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02734  NADH-ubiquinone oxidoreductase  48.29 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0062  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.19 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2358  electron transport complex RsxE subunit  46.08 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1381  electron transport complex RsxE subunit  46 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2069  electron transport complex RsxE subunit  47.32 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00102029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1906  electron transport complex RsxE subunit  47.32 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02969  electron transport complex RsxE subunit  45.33 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2173  electron transport complex RsxE subunit  47.32 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.303807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0533  electron transport complex RsxE subunit  48.78 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000076694  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1868  electron transport complex RsxE subunit  45 
 
 		 231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1064  electron transport complex RsxE subunit  45.77 
 
 		 218 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0737938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2020  electron transport complex RsxE subunit  44.86 
 
 		 235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0685  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  48.39 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.360116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2012  electron transport complex RsxE subunit  44.5 
 
 		 233 aa  171  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00017811  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002944  electron transport complex protein RnfE  44.86 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0179212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2320  electron transport complex RsxE subunit  46.34 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19220  electron transport complex RsxE subunit  45.37 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0288  electron transport complex RsxE subunit  46.97 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1900  electron transport complex RsxE subunit  44.04 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000164726  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2248  electron transport complex RsxE subunit  44.04 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000887941  normal  0.482499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1031  electron transport complex RsxE subunit  44.44 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000559383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1835  electron transport complex RsxE subunit  45.25 
 
 		 232 aa  168  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.521191  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2071  electron transport complex RsxE subunit  45.28 
 
 		 232 aa  167  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2177  electron transport complex RsxE subunit  46.01 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.206237  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2194  electron transport complex RsxE subunit  42.34 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2159  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  42.79 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1921  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.02 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1399  electron transport complex RsxE subunit  43.96 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0733  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.32 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1324  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  41.84 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000680415  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2561  electron transport complex RsxE subunit  44.61 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.428281  normal  0.0236645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0548  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  43.78 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.614250000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2039  electron transport complex RsxE subunit  43.58 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2819  electron transport complex RsxE subunit  42.86 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2631  electron transport complex RsxE subunit  44.17 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.854749  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3237  electron transport complex RsxE subunit  42.57 
 
 		 239 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1567  electron transport complex RsxE subunit  44.65 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.276457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1841  electron transport complex RsxE subunit  44.65 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000217086  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0835  electron transport complex RsxE subunit  41.46 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0472415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2344  electron transport complex RsxE subunit  44.65 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00490465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1821  electron transport complex RsxE subunit  44.65 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50930  Electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  42.58 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1490  electron transport complex RsxE subunit  41.67 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2020  electron transport complex RsxE subunit  43.2 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1158  electron transport complex RsxE subunit  38.05 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1816  electron transport complex RsxE subunit  44.24 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0219521  decreased coverage  0.000344211 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0811  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  47.09 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.586167  normal  0.660499 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1170  electron transport complex RsxE subunit  45.89 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18890  electron transport complex RsxE subunit  45.19 
 
 		 238 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0559311  normal  0.0454317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01602  NADH-ubiquinone oxidoreductase  45.19 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00455055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2009  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.19 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206921  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1708  electron transport complex RsxE subunit  45.19 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01592  hypothetical protein  45.19 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00529631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1997  electron transport complex RsxE subunit  45.19 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2235  electron transport complex RsxE subunit  42.93 
 
 		 232 aa  154  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3197  electron transport complex RsxE subunit  38.11 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.113387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1564  electron transport complex RsxE subunit  44.8 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.257712  normal  0.0772811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1624  electron transport complex RsxE subunit  44.8 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  normal  0.350823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1552  electron transport complex RsxE subunit  44.8 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3197  electron transport complex RsxE subunit  41.28 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0099576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1720  electron transport complex RsxE subunit  44.8 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208116  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3936  electron transport complex RsxE subunit  41.28 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000255424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1888  electron transport complex RsxE subunit  44.8 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>