More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2044 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2044  agmatinase  100 
 
 		 301 aa  625  1e-178  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.661997  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00520  arginase  59.66 
 
 		 316 aa  358  8e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.960091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0721  putative agmatinase  39.86 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1414  agmatinase  40.07 
 
 		 295 aa  205  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000244509  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1538  agmatinase  36.43 
 
 		 289 aa  199  7e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.04187  unclonable  1.26381e-19 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3780  putative agmatinase  38.41 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.547694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3564  putative agmatinase  36.04 
 
 		 296 aa  185  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2696  agmatinase  33.45 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4857  putative agmatinase  34.98 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2513  putative agmatinase  32.71 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0838  agmatinase  32.3 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0733  agmatinase  32.3 
 
 		 293 aa  142  9e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.983963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1275  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.75 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  35.9 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2584  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.12 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.704538  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1365  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.12 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1264  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.81 
 
 		 341 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0574  agmatinase, putative  31.07 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  34.81 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3076  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.86 
 
 		 367 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.504729 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  34.2 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  32.71 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1313  agmatinase  33.45 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501351  normal  0.021834 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  33.21 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  34.2 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  34.04 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  33.81 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  32.38 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  33.95 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  34.32 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2261  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.86 
 
 		 346 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  32.12 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1609  agmatinase  29.86 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0169673  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  31.19 
 
 		 326 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  31.19 
 
 		 326 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  33.7 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  31.19 
 
 		 326 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0745  agmatinase  33.45 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00217133  hitchhiker  0.00435081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  34.78 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  30.14 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  30.14 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  32.21 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  35.53 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  29.5 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0127  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.39 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  32.01 
 
 		 290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  34.72 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  28.73 
 
 		 279 aa  116  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  33.33 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  30.32 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  30 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1151  hypothetical protein  25.38 
 
 		 347 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  28.08 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  28.33 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  30.93 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  29.75 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0074  agmatinase  28.94 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  28.77 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  31.62 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2336  agmatinase  28.27 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2118  agmatinase  34.95 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  29.6 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  31.52 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  31.46 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  30.69 
 
 		 293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  27.92 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  27.92 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  27.92 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  28.78 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  29.79 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0425  agmatinase  29.17 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.509578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  27.36 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  29.68 
 
 		 289 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  32.43 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  31.17 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2384  agmatinase  31.39 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  28.67 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  28.88 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33400  agmatinase  31.43 
 
 		 343 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.294688 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0497  agmatinase  28.05 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  30.32 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  29.27 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  29.01 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  31.21 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  31.21 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  31.21 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  31.21 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  28.33 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  27.96 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  27.42 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  28.83 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3103  agmatinase  26.87 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  30.13 
 
 		 250 aa  99.4  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  30.86 
 
 		 291 aa  99.8  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1577  agmatinase  29.72 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.255139 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  26.96 
 
 		 317 aa  99  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  27.84 
 
 		 320 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  30.43 
 
 		 345 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  26.87 
 
 		 319 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  29.1 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>