More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2015 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  100 
 
 
497 aa  1038    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  49.3 
 
 
517 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  51.21 
 
 
522 aa  482  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  47.9 
 
 
513 aa  461  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1755  sulfatase  46.07 
 
 
562 aa  422  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  43.66 
 
 
554 aa  423  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  32.8 
 
 
470 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  33.54 
 
 
631 aa  219  8.999999999999998e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  32.81 
 
 
478 aa  216  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  32.73 
 
 
510 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  30.1 
 
 
517 aa  205  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  30.53 
 
 
482 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  31.54 
 
 
492 aa  196  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  30.83 
 
 
484 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  30.86 
 
 
490 aa  196  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  30.56 
 
 
472 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  31.17 
 
 
471 aa  193  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  30.63 
 
 
479 aa  192  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  30.83 
 
 
453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  28.45 
 
 
470 aa  180  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  30.18 
 
 
452 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  30.86 
 
 
539 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  30.97 
 
 
457 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  28.51 
 
 
489 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  28.88 
 
 
724 aa  170  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  30.08 
 
 
487 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1879  sulfatase  30.92 
 
 
462 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  29.04 
 
 
474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  29.31 
 
 
519 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  28.13 
 
 
559 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  30.71 
 
 
482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  30.57 
 
 
467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.95 
 
 
497 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  29.04 
 
 
497 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  29 
 
 
495 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  28.95 
 
 
497 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  28.03 
 
 
500 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  29.04 
 
 
497 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.17 
 
 
497 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  27.87 
 
 
543 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  29.3 
 
 
465 aa  161  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  27.08 
 
 
480 aa  159  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  28.04 
 
 
500 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  28.99 
 
 
553 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  29.42 
 
 
637 aa  157  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  28.6 
 
 
462 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  28.34 
 
 
442 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  28.01 
 
 
536 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  27.15 
 
 
486 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  24.81 
 
 
501 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  28.04 
 
 
497 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  25.94 
 
 
480 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  27.56 
 
 
440 aa  149  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  26.29 
 
 
481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  26.87 
 
 
548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  28.15 
 
 
462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  27.03 
 
 
523 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  26.3 
 
 
582 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  28.51 
 
 
438 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  26.49 
 
 
584 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  27.16 
 
 
555 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  29.1 
 
 
442 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  29.15 
 
 
491 aa  145  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  27.27 
 
 
460 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  28.16 
 
 
453 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  27.87 
 
 
506 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  26.32 
 
 
551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  27.29 
 
 
493 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  26.1 
 
 
535 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  26.1 
 
 
535 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  27.22 
 
 
536 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  26.1 
 
 
535 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  26.35 
 
 
543 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  25.81 
 
 
457 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  28.54 
 
 
491 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  27.44 
 
 
483 aa  137  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  29.8 
 
 
486 aa  137  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  28.72 
 
 
458 aa  137  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  28.21 
 
 
497 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  27.24 
 
 
578 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  27.14 
 
 
481 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  28.67 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  27.04 
 
 
468 aa  133  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  25.09 
 
 
542 aa  133  7.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42934  arylsulfatase  27.4 
 
 
564 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  25.13 
 
 
536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  28.66 
 
 
459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  24.96 
 
 
536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  26.8 
 
 
466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  25.4 
 
 
533 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  26.74 
 
 
563 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  25.05 
 
 
551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  28.39 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  25.05 
 
 
551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  27.05 
 
 
551 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  27.05 
 
 
551 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  27.05 
 
 
551 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  25.1 
 
 
537 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  26.06 
 
 
489 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  25.96 
 
 
453 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>