More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0846 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0846  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  100 
 
 
326 aa  656  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.908652  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  49.65 
 
 
339 aa  283  2e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  45.65 
 
 
319 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  49.66 
 
 
315 aa  267  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  42.11 
 
 
322 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  42.11 
 
 
322 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  50.93 
 
 
317 aa  256  4e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  50.18 
 
 
274 aa  253  2e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  49.82 
 
 
327 aa  252  5e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  46.32 
 
 
322 aa  247  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  49.43 
 
 
338 aa  244  1e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.16966e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  45.61 
 
 
324 aa  244  2e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  45.1 
 
 
327 aa  244  2e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.93 
 
 
320 aa  242  8e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  42.72 
 
 
318 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2150  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.55 
 
 
328 aa  238  9e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  46.69 
 
 
319 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  43.67 
 
 
316 aa  232  8e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  39.93 
 
 
334 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.66306e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2957  Glyoxylate reductase  40.78 
 
 
320 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  8.53458e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  42.81 
 
 
322 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.45 
 
 
323 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  38.96 
 
 
319 aa  223  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.59 
 
 
329 aa  221  1e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.49 
 
 
319 aa  221  1e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.49 
 
 
319 aa  221  1e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  48.94 
 
 
321 aa  219  6e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1989  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40 
 
 
332 aa  219  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.14509e-07 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  46.32 
 
 
327 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  41.03 
 
 
341 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.82 
 
 
323 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2276  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.32 
 
 
321 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1251  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.46 
 
 
322 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  46.32 
 
 
318 aa  215  8e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1652  gluconate 2-dehydrogenase  47.13 
 
 
321 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.999002  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1652  gluconate 2-dehydrogenase  46.72 
 
 
321 aa  214  2e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  43.37 
 
 
334 aa  213  5e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0128  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.49 
 
 
320 aa  212  6e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0232098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  40.24 
 
 
340 aa  212  6e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1043  2-hydroxyacid dehydrogenase  43.65 
 
 
324 aa  212  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.344903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0864  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.75 
 
 
324 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2057  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  44.36 
 
 
314 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1982  putative 2-ketogluconate 6-phosphate reductase, TkrA  43.32 
 
 
321 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0969942 
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  39.43 
 
 
331 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2371  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.04 
 
 
317 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.421154  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2328  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.04 
 
 
317 aa  210  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  44.16 
 
 
332 aa  210  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1528  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  46.31 
 
 
321 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.27928  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4137  2-ketogluconate reductase  40.29 
 
 
326 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3789  2-ketogluconate reductase  40.29 
 
 
326 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13500  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  45.9 
 
 
325 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1744  gluconate 2-dehydrogenase  46.31 
 
 
321 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.513456 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6348  gluconate 2-dehydrogenase  46.31 
 
 
321 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1731  gluconate 2-dehydrogenase  46.31 
 
 
321 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1215  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  43.95 
 
 
324 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1511  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  42.22 
 
 
330 aa  209  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2286  2-ketogluconate reductase  46.72 
 
 
325 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2151  gluconate 2-dehydrogenase  46.72 
 
 
325 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00341832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2094  gluconate 2-dehydrogenase  46.72 
 
 
325 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0017  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.93 
 
 
326 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1436  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.29 
 
 
524 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0936  2-hydroxyacid dehydrogenase  44.27 
 
 
326 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0758  Gluconate 2-dehydrogenase  45.1 
 
 
324 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.163484  normal  0.223338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  43.82 
 
 
328 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1209  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  47.01 
 
 
325 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2298  2-ketogluconate reductase  46.72 
 
 
325 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5027  gluconate 2-dehydrogenase  45.9 
 
 
321 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.19225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1980  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.27 
 
 
337 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00177006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4462  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.72 
 
 
324 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0516  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  37.67 
 
 
323 aa  205  7e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1261  2-hydroxyacid dehydrogenase  44.72 
 
 
324 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.829817  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4585  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.53 
 
 
324 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177962  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  43.96 
 
 
357 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0038  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.93 
 
 
320 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3943  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.48 
 
 
333 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.63 
 
 
326 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5208  Glyoxylate reductase  42.9 
 
 
309 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1506  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  42.02 
 
 
339 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0180022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1325  glycerate dehydrogenase  42.02 
 
 
323 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1434  glycerate dehydrogenase  42.02 
 
 
323 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.215188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1298  glycerate dehydrogenase  41.69 
 
 
323 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.952061  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.39 
 
 
338 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2571  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.17 
 
 
321 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24433  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0055  Gluconate 2-dehydrogenase  42.19 
 
 
321 aa  201  1e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1888  glycerate dehydrogenase  40.54 
 
 
317 aa  201  1e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1574  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  42.52 
 
 
323 aa  201  1e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01261  glyoxylate reductase  41.91 
 
 
357 aa  201  1e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4173  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.73 
 
 
320 aa  201  2e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  43.26 
 
 
333 aa  200  2e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1535  glycerate dehydrogenase  41.69 
 
 
323 aa  200  2e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0811  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.56 
 
 
329 aa  201  2e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868894  normal  0.495014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4455  Gluconate 2-dehydrogenase  41.98 
 
 
320 aa  201  2e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1299  glycerate dehydrogenase  41.69 
 
 
323 aa  201  2e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4409  Glyoxylate reductase  43.26 
 
 
333 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01500  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  40.62 
 
 
329 aa  200  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6845  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.31 
 
 
321 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1337  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  41.5 
 
 
323 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  40.57 
 
 
330 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.07425e-10 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0193  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  45.26 
 
 
329 aa  199  4e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2171  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  43.12 
 
 
319 aa  199  4e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>