More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0825 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0825  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 500 aa  1029    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1108  cysteinyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 		 473 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.917766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0061  cysteinyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 		 474 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.63624  normal  0.0841758 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 473 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0065  cysteinyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 476 aa  550  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 474 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 465 aa  379  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1725  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 472 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5216  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 465 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00001018  unclonable  2.47403e-25 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0967  cysteinyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0501799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3036  cysteinyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0110  cysteinyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 465 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.033401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 493 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1829  cysteinyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2138  cysteinyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 478 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 468 aa  369  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0902  cysteinyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 474 aa  365  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 484 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 476 aa  364  2e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 481 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 487 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0061  cysteinyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 458 aa  359  6e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 486 aa  359  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_61  cysteinyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 457 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0055  cysteinyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 485 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 485 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 466 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 488 aa  357  3.9999999999999996e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 476 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0382  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 475 aa  354  2e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 478 aa  354  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 500 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 485 aa  353  4e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 490 aa  352  1e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 460 aa  351  2e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 460 aa  351  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 470 aa  350  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 466 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 459 aa  350  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 485 aa  349  6e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 466 aa  349  8e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 487 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 459 aa  348  2e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0097  cysteinyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 470 aa  346  5e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0748352  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 465 aa  346  5e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 460 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 485 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 460 aa  345  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 461 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2077  cysteinyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 465 aa  344  2.9999999999999997e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0303  cysteinyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 470 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209155  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 460 aa  343  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2732  cysteinyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 474 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.511576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 461 aa  342  5.999999999999999e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 494 aa  342  7e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 461 aa  342  9e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 454 aa  342  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1831  cysteinyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 469 aa  342  1e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0215074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 481 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 484 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 484 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 461 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0338  cysteinyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 472 aa  341  2e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000985703  hitchhiker  0.00000017831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 469 aa  340  4e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 459 aa  340  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 482 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>