35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0112 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0112  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 182 aa  359  1e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.1301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  45.51 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2145  XRE family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1247  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 165 aa  97.4  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.797623  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  44.97 
 
 		 134 aa  93.2  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0621  XRE family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 161 aa  89  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2276  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2112  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.79317  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1037  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.223775  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  31.52 
 
 		 162 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1462  helix-turn-helix domain-containing protein  28.81 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217714  normal  0.212223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1304  helix-turn-helix domain-containing protein  30.17 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0938  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117119  normal  0.710013 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0459  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1762  XRE family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1025  XRE family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0919  helix-turn-helix domain-containing protein  24.72 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.960971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2372  transcriptional regulator, XRE family  28.09 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0360  transcriptional regulator, XRE family  28.19 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0951  helix-turn-helix domain-containing protein  25.71 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0686  transcriptional regulator, XRE family  40.86 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1173  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.359549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1903  transcriptional regulator, XRE family  26.88 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0604  transcriptional regulator, XRE family  25.38 
 
 		 183 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2500  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 69 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  32.2 
 
 		 123 aa  42.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2125  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 66 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 125 aa  41.6  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.73 
 
 		 376 aa  41.6  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 104 aa  41.2  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 118 aa  41.2  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2271  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.571583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>