More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1790 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  100 
 
 
168 aa  343  4e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  1.45412e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  70.83 
 
 
168 aa  250  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  68.07 
 
 
168 aa  244  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  1.69928e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  65.66 
 
 
168 aa  228  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  2.25283e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  62.65 
 
 
172 aa  222  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  5.1086e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
165 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
163 aa  87.8  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  34.81 
 
 
161 aa  81.3  6e-15  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 
160 aa  79.7  2e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
141 aa  79  3e-14  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
147 aa  74.7  5e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  6.16693e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
148 aa  72.4  3e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5820  hypothetical protein  34.23 
 
 
158 aa  70.9  9e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67120  hypothetical protein  33.56 
 
 
158 aa  68.6  4e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  31.97 
 
 
159 aa  66.6  1e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 
158 aa  66.6  1e-10  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  29.79 
 
 
147 aa  66.6  1e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  29.79 
 
 
147 aa  65.9  2e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  30.5 
 
 
155 aa  66.2  2e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  29.79 
 
 
147 aa  65.9  2e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  29.08 
 
 
147 aa  65.5  3e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
154 aa  65.1  4e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
156 aa  65.1  4e-10  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  29.08 
 
 
147 aa  64.3  7e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  30.5 
 
 
157 aa  63.9  1e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
174 aa  63.5  1e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 
147 aa  63.9  1e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  33.62 
 
 
140 aa  63.5  1e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
147 aa  63.5  1e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  33.62 
 
 
140 aa  63.5  1e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  33.62 
 
 
140 aa  63.9  1e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  33.62 
 
 
140 aa  63.5  1e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  33.62 
 
 
140 aa  63.2  2e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.77041e-14 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
147 aa  63.2  2e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
140 aa  63.2  2e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  29.58 
 
 
147 aa  62  3e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
158 aa  62.4  3e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  32.64 
 
 
153 aa  62  4e-09  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  32.76 
 
 
140 aa  62  4e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
146 aa  61.6  4e-09  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
299 aa  62  4e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
441 aa  62  4e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  28.37 
 
 
147 aa  61.2  7e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  29.79 
 
 
157 aa  60.8  9e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
153 aa  59.3  2e-08  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  32.76 
 
 
140 aa  59.3  2e-08  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1478e-21 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
146 aa  60.1  2e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  38.89 
 
 
147 aa  59.7  2e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  32.76 
 
 
140 aa  59.7  2e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
163 aa  59.3  2e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
155 aa  58.9  3e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 
298 aa  58.9  3e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
169 aa  59.3  3e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  29.08 
 
 
155 aa  58.9  3e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  26.71 
 
 
162 aa  58.9  3e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
158 aa  58.9  3e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  30.14 
 
 
147 aa  58.5  4e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  29.08 
 
 
157 aa  58.5  5e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
146 aa  57.4  8e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  25 
 
 
155 aa  57.8  8e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 
147 aa  57.4  9e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 
147 aa  57.4  9e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
142 aa  57.4  9e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  1.61401e-06 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
179 aa  57.4  1e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 
157 aa  57  1e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  4.52555e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
134 aa  57.4  1e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2830  mutT/nudix family protein  28.47 
 
 
155 aa  57  1e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
179 aa  57.4  1e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
173 aa  57  1e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 
146 aa  56.6  1e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
174 aa  57.4  1e-07  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3044  mutT/nudix family protein  28.47 
 
 
155 aa  57  1e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 
156 aa  56.2  2e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0751  mutT/nudix family protein  36.67 
 
 
109 aa  56.6  2e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
169 aa  56.6  2e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  30.88 
 
 
147 aa  55.8  2e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.63334e-09 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  31.4 
 
 
156 aa  55.5  3e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.76833e-07 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  27.4 
 
 
148 aa  55.5  3e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
141 aa  55.5  3e-07  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  29.41 
 
 
147 aa  55.5  3e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  30 
 
 
147 aa  55.8  3e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.3854e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  30 
 
 
147 aa  55.8  3e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3081  mutT/nudix family protein  28.37 
 
 
155 aa  55.5  3e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
169 aa  55.1  4e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  26.81 
 
 
147 aa  55.1  4e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
228 aa  54.7  5e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  29.08 
 
 
155 aa  54.7  5e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  3.69619e-13 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
153 aa  54.7  6e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  28.82 
 
 
147 aa  54.3  7e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  28.28 
 
 
131 aa  54.3  7e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  2.39001e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  33.05 
 
 
430 aa  54.3  8e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  28.28 
 
 
131 aa  54.3  9e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.36995e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 
146 aa  53.5  1e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  27.94 
 
 
147 aa  53.9  1e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  29.66 
 
 
158 aa  53.5  1e-06  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  33.33 
 
 
258 aa  53.9  1e-06  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
144 aa  53.9  1e-06  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
155 aa  53.9  1e-06  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  28.24 
 
 
147 aa  52.8  2e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.92929e-05 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
205 aa  53.1  2e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>