More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0294 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  100 
 
 		 318 aa  638    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  78.73 
 
 		 315 aa  524  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  79.05 
 
 		 315 aa  523  1e-147  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  78.1 
 
 		 315 aa  519  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  54.46 
 
 		 311 aa  347  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  52.09 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  51.95 
 
 		 342 aa  318  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  52.09 
 
 		 310 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1362  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.8 
 
 		 333 aa  315  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  51.48 
 
 		 310 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  51.92 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6257  KpsF/GutQ family protein  50.48 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.78 
 
 		 321 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  49.35 
 
 		 321 aa  312  3.9999999999999997e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  51.6 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5916  KpsF/GutQ family protein  52.56 
 
 		 310 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3211  KpsF/GutQ family sugar isomerase  49.84 
 
 		 311 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3249  KpsF/GutQ family sugar isomerase  49.84 
 
 		 311 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212815  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3262  arabinose-5-phosphate isomerase  49.84 
 
 		 351 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  51.43 
 
 		 332 aa  305  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 323 aa  305  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.45 
 
 		 319 aa  305  8.000000000000001e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0064  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  50.81 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  52.19 
 
 		 333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  51.46 
 
 		 321 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  50.17 
 
 		 335 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  52.19 
 
 		 330 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  49.21 
 
 		 320 aa  301  7.000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  49.19 
 
 		 333 aa  300  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  49.67 
 
 		 329 aa  299  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  47.99 
 
 		 320 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  47.99 
 
 		 320 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5735  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.59 
 
 		 320 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 322 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1886  arabinose 5-phosphate isomerase  49.21 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106886  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  47.94 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  48.39 
 
 		 339 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 322 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  49.04 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  49.84 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6185  KpsF/GutQ family protein  53.68 
 
 		 291 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  49.2 
 
 		 320 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  48.73 
 
 		 321 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  49.21 
 
 		 320 aa  292  6e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  48.39 
 
 		 333 aa  291  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  49.84 
 
 		 323 aa  291  8e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  50.34 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  47.74 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  51.51 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  47.56 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  46.45 
 
 		 333 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  50.33 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.39 
 
 		 342 aa  289  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.39 
 
 		 357 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  48.73 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  49.21 
 
 		 326 aa  289  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.39 
 
 		 328 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5957  KpsF/GutQ family protein  46.45 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  48.73 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  48.7 
 
 		 330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  47.17 
 
 		 330 aa  288  6e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  47.48 
 
 		 330 aa  288  6e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  45.95 
 
 		 339 aa  288  7e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  48.18 
 
 		 330 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 326 aa  286  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  50.32 
 
 		 322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0591  KpsF/GutQ family protein  50.49 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000664449  hitchhiker  0.000000000000829793 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  47.28 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 328 aa  285  7e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  48.43 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.11 
 
 		 328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  46.62 
 
 		 329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.1 
 
 		 328 aa  282  5.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  46.1 
 
 		 322 aa  282  5.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  45.19 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  47.13 
 
 		 330 aa  281  7.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  44.44 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  44.69 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  49.22 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.83 
 
 		 328 aa  279  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  48.9 
 
 		 326 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  46.5 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1810  KpsF/GutQ  48.24 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220338  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.51 
 
 		 328 aa  278  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  45.51 
 
 		 328 aa  278  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  45.51 
 
 		 328 aa  278  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.51 
 
 		 328 aa  278  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.51 
 
 		 328 aa  278  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.51 
 
 		 328 aa  278  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.51 
 
 		 328 aa  278  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.51 
 
 		 328 aa  278  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  48.23 
 
 		 315 aa  278  6e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  49.35 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  49.36 
 
 		 324 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  49.36 
 
 		 324 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 328 aa  278  9e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.83 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.83 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>