More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04310 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  100 
 
 		 349 aa  722    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  59.74 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  56.04 
 
 		 332 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  47.06 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  39.46 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  39.63 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  40.61 
 
 		 514 aa  243  3e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  40.36 
 
 		 314 aa  239  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  40.14 
 
 		 301 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  36.97 
 
 		 506 aa  223  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  40.84 
 
 		 311 aa  222  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  36.45 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  35.35 
 
 		 293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  35.98 
 
 		 323 aa  220  3e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  37.07 
 
 		 298 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  35.65 
 
 		 316 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  35.84 
 
 		 316 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  35.84 
 
 		 316 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  35.54 
 
 		 316 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  36.84 
 
 		 316 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  35.24 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  35.65 
 
 		 316 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  35.24 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  34.94 
 
 		 316 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  33.63 
 
 		 307 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  37.54 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  36.84 
 
 		 316 aa  212  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  35.05 
 
 		 304 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  33.92 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  40.34 
 
 		 312 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  36.56 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  35.84 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  36.53 
 
 		 311 aa  202  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  34.41 
 
 		 304 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  39.04 
 
 		 312 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  32.43 
 
 		 316 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  39.12 
 
 		 324 aa  195  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  38.56 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  34.5 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  34.98 
 
 		 306 aa  192  9e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  30.61 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  30.61 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  36.73 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  32.37 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  35.63 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  34.8 
 
 		 296 aa  186  7e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  36.15 
 
 		 321 aa  186  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  36.94 
 
 		 265 aa  185  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  37.84 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  37.76 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  35.57 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  32.09 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  32.23 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  31.53 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  34.47 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  33.97 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  35.15 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  33.52 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  36.77 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  33.02 
 
 		 323 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  32.52 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  37.15 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  39.56 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  31.68 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  33.88 
 
 		 309 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  33.88 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  32.67 
 
 		 322 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  33.55 
 
 		 307 aa  169  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  34.35 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  30.21 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  31.69 
 
 		 328 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  29.94 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  34.13 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  34.02 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  31.87 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  36.84 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  33.56 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  32.91 
 
 		 310 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  34.34 
 
 		 293 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  30.63 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  32.27 
 
 		 310 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  34.07 
 
 		 307 aa  159  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  36.23 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  30.33 
 
 		 290 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  30.09 
 
 		 292 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  32.59 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  30.33 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  30.09 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  32.87 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  30.35 
 
 		 362 aa  153  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  30.22 
 
 		 313 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  32.65 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.12 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  34.33 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  34.25 
 
 		 311 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>