287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2644 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  100 
 
 
2178 aa  4432    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  39.67 
 
 
2207 aa  144  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  34.12 
 
 
1452 aa  131  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  39.2 
 
 
1729 aa  126  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11480  conserved repeat protein  28.05 
 
 
1893 aa  114  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  35.03 
 
 
631 aa  95.9  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.05 
 
 
6885 aa  91.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  29.85 
 
 
1174 aa  90.9  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  30 
 
 
1457 aa  86.3  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00410  conserved repeat protein  37.65 
 
 
1406 aa  86.3  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0351044  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  28.73 
 
 
3320 aa  86.3  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2643  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.05 
 
 
462 aa  85.5  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  29.44 
 
 
2073 aa  85.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  31.82 
 
 
1013 aa  85.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  30.11 
 
 
609 aa  83.2  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  30.39 
 
 
1847 aa  82.8  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.64 
 
 
1016 aa  81.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  30.68 
 
 
2375 aa  80.1  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  31.46 
 
 
1821 aa  79  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  31.98 
 
 
880 aa  77.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  30 
 
 
1260 aa  77.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  28.18 
 
 
1009 aa  77.4  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  30.17 
 
 
506 aa  77  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  31.76 
 
 
932 aa  76.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  31.21 
 
 
548 aa  76.3  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  29.73 
 
 
2286 aa  75.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1376  S-layer domain protein  26.06 
 
 
594 aa  75.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000547431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  29.71 
 
 
527 aa  74.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  28.4 
 
 
524 aa  74.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25 
 
 
1661 aa  74.7  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 
1321 aa  74.3  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.05 
 
 
843 aa  73.6  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  32.95 
 
 
618 aa  73.6  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  32.58 
 
 
547 aa  73.2  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  31.74 
 
 
758 aa  73.2  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0800  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.82 
 
 
529 aa  72  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000328713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  30.81 
 
 
573 aa  71.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  27.27 
 
 
1495 aa  71.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  29.65 
 
 
876 aa  71.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  28.07 
 
 
807 aa  70.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  27.91 
 
 
506 aa  70.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3463  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.81 
 
 
575 aa  70.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.219832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2693  S-layer domain protein  31.29 
 
 
189 aa  70.5  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3737  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.81 
 
 
575 aa  70.5  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0986  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.65 
 
 
529 aa  70.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.46837e-61 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  30.3 
 
 
1226 aa  69.7  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  28.65 
 
 
754 aa  69.3  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0851  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.65 
 
 
529 aa  69.3  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000657012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.65 
 
 
529 aa  69.3  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000140449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  27.7 
 
 
935 aa  68.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1889  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.8 
 
 
414 aa  67.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000270589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1938  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  24.8 
 
 
414 aa  67.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000112204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3692  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.25 
 
 
575 aa  68.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00650388 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1079  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.49 
 
 
529 aa  67.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000334554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0789  S-layer protein sap precursor  26.26 
 
 
814 aa  68.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  32.57 
 
 
625 aa  67.4  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0841  S-layer protein Sap  26.26 
 
 
814 aa  67.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0885  s-layer protein sap  26.26 
 
 
814 aa  67.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  28.09 
 
 
538 aa  67  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  25 
 
 
756 aa  66.6  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  27.17 
 
 
914 aa  66.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  28.88 
 
 
1208 aa  65.9  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0984  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.93 
 
 
529 aa  65.9  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000810888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1010  NEAr transporter  26.39 
 
 
343 aa  65.9  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2329  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.57 
 
 
596 aa  65.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.19 
 
 
995 aa  65.5  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.62 
 
 
539 aa  65.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000635651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  27.49 
 
 
921 aa  65.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  29.17 
 
 
526 aa  65.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3361  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 
575 aa  65.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000479287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  29.19 
 
 
1168 aa  65.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  26.73 
 
 
376 aa  65.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 
533 aa  64.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2160  S-layer protein  27.94 
 
 
383 aa  64.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.028807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  27.23 
 
 
575 aa  64.7  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 
533 aa  64.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2340  putative S-layer protein  27.94 
 
 
383 aa  64.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  44.87 
 
 
613 aa  64.7  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2315  S-layer protein  27.94 
 
 
383 aa  64.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3710  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.55 
 
 
575 aa  64.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0725  cell wall hydrolase/autolysin  27.65 
 
 
520 aa  64.3  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00509624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3716  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.55 
 
 
575 aa  64.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.597701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1075  S-layer-like domain-containing protein  26.24 
 
 
376 aa  63.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  23.2 
 
 
414 aa  63.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.72375e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1682  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.2 
 
 
414 aa  63.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000845994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2240  hypothetical protein  31.97 
 
 
221 aa  63.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.55 
 
 
194 aa  63.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1817  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.2 
 
 
414 aa  63.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000725042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.42 
 
 
572 aa  63.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  30.7 
 
 
220 aa  63.2  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  27.33 
 
 
693 aa  63.2  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0903  S-layer protein  27.23 
 
 
379 aa  63.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949153  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  26.74 
 
 
822 aa  62.8  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3133  S-layer domain protein  26.59 
 
 
604 aa  62.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  26.59 
 
 
939 aa  62.4  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  25.67 
 
 
733 aa  62.4  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1180  S-layer domain protein  30.7 
 
 
220 aa  62.4  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0776761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0962  hypothetical protein  26.7 
 
 
579 aa  62  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4145  S-layer domain-containing protein  28.24 
 
 
601 aa  62.4  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  28.14 
 
 
930 aa  62  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>