215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0039 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0039  S-layer domain protein  100 
 
 		 337 aa  693    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  37.35 
 
 		 585 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  27.91 
 
 		 1421 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1192  hypothetical protein  28.18 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  27.23 
 
 		 573 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  27.4 
 
 		 524 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.35 
 
 		 539 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000635651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  30.69 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  27.57 
 
 		 1174 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  31.22 
 
 		 820 aa  67  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  28.65 
 
 		 2207 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.67 
 
 		 1016 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  26.89 
 
 		 620 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1079  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.23 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000334554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  25.67 
 
 		 620 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  30.81 
 
 		 729 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  26.46 
 
 		 548 aa  63.5  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0986  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.75 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.46837e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0851  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.75 
 
 		 529 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000657012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.75 
 
 		 529 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000140449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  26.14 
 
 		 620 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740229  hitchhiker  0.00000000000010382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  28.42 
 
 		 935 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  28.98 
 
 		 932 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  26.56 
 
 		 710 aa  63.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2168  peptidase  26.53 
 
 		 731 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0287346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.65 
 
 		 1661 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.98 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.98 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1010  NEAr transporter  31.89 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  27.98 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  28.49 
 
 		 1847 aa  59.7  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0800  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.75 
 
 		 529 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000328713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0984  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.75 
 
 		 529 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000810888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1195  S-layer protein, putative  30.43 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  29.67 
 
 		 758 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  28.04 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  26.53 
 
 		 754 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2561  hypothetical protein  24.18 
 
 		 831 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  23.48 
 
 		 1321 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1008  cell-wall amidase, pXO2-42-like protein  29.67 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.8241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1979  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.13 
 
 		 599 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  25.36 
 
 		 1168 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  26.94 
 
 		 548 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  26.13 
 
 		 599 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  26.73 
 
 		 1495 aa  56.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1021  S-layer protein  29.67 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  30.41 
 
 		 410 aa  55.8  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0962  hypothetical protein  24.1 
 
 		 579 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.61 
 
 		 1029 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3463  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.46 
 
 		 575 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.219832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2329  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.61 
 
 		 596 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1093  S-layer protein  29.67 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1177  putative S-layer protein  29.67 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1252  putative S-layer protein  28.57 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.678676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3737  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.46 
 
 		 575 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  26.52 
 
 		 657 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3361  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.02 
 
 		 575 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000479287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.5 
 
 		 579 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00112193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  28.57 
 
 		 527 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  27.5 
 
 		 506 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.87 
 
 		 591 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.653459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  24.02 
 
 		 822 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2393  S-layer domain protein  28.26 
 
 		 522 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000002124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  26.75 
 
 		 692 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  22.97 
 
 		 807 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.42 
 
 		 194 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  26.37 
 
 		 631 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0963  hypothetical protein  23.5 
 
 		 579 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  26.92 
 
 		 1226 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3710  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.65 
 
 		 575 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3692  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.94 
 
 		 575 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00650388 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3716  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.65 
 
 		 575 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.597701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  25.27 
 
 		 756 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.81 
 
 		 6885 aa  53.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  24.74 
 
 		 921 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  26.17 
 
 		 615 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  29.53 
 
 		 2286 aa  53.1  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1207  putative S-layer protein  22.37 
 
 		 219 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.341169 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  25.68 
 
 		 410 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0829  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23 
 
 		 397 aa  52.8  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  29.26 
 
 		 2073 aa  52.8  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1260 aa  52.8  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3295  S-layer protein, putative  27.78 
 
 		 591 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1050  hypothetical protein  24.08 
 
 		 578 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  25.94 
 
 		 880 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  26.2 
 
 		 618 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1027  S-layer protein  22.22 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0927071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2982  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  26.77 
 
 		 591 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0872  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2917  S-layer domain-containing protein  26.7 
 
 		 805 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.463715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  28.33 
 
 		 1154 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.67 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3089  S-layer protein  25.76 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.706009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.67 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3033  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  25.76 
 
 		 591 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4533  S-layer protein  25.29 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3311  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.76 
 
 		 591 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.67 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.13 
 
 		 843 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3667  putative S-layer protein  25.16 
 
 		 502 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.290497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>