More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0987 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 
285 aa  568  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  46.89 
 
 
319 aa  222  7e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.07 
 
 
286 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  46.35 
 
 
274 aa  208  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  44.65 
 
 
283 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  41.9 
 
 
289 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  39.01 
 
 
286 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  41.7 
 
 
292 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.33 
 
 
299 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  42.91 
 
 
291 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.79 
 
 
289 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  45.02 
 
 
317 aa  195  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  40.91 
 
 
293 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.49 
 
 
306 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  41.55 
 
 
298 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  42.42 
 
 
325 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  44.76 
 
 
292 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  43.08 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  42.91 
 
 
275 aa  188  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.95 
 
 
296 aa  186  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  45.56 
 
 
296 aa  185  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  43.13 
 
 
276 aa  185  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  39.85 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  40.73 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  37.77 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.38 
 
 
283 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  38.01 
 
 
283 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  40.64 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  37.04 
 
 
285 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.56 
 
 
296 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  41.16 
 
 
295 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  38.35 
 
 
284 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  37.33 
 
 
297 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  40.07 
 
 
274 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  40.49 
 
 
287 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  37.59 
 
 
284 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  39.47 
 
 
278 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.76 
 
 
300 aa  175  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  43.57 
 
 
289 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  38.43 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.31 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  44.14 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  36.63 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  38.01 
 
 
587 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  38.85 
 
 
307 aa  171  9e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  37.64 
 
 
587 aa  171  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.36 
 
 
285 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  38.87 
 
 
285 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  36.92 
 
 
284 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  40 
 
 
285 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  35.09 
 
 
302 aa  168  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  40.43 
 
 
286 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  39.38 
 
 
275 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  39.77 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.11 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  39.56 
 
 
289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.42 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  38.31 
 
 
283 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0855  modification methylase HemK  35.02 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.1 
 
 
286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  35.77 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  37.85 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  39.78 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  41.67 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  40.65 
 
 
276 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  36.3 
 
 
270 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  35.76 
 
 
289 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.52 
 
 
288 aa  162  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  37.55 
 
 
279 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  40.74 
 
 
276 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.59 
 
 
276 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  34.63 
 
 
280 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.84 
 
 
276 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  35.93 
 
 
295 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  34.39 
 
 
285 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  39.02 
 
 
280 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.32 
 
 
279 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  33.69 
 
 
285 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  34.81 
 
 
298 aa  158  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  34.1 
 
 
277 aa  158  9e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  35.14 
 
 
286 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.44 
 
 
283 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  34.1 
 
 
277 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  36.2 
 
 
284 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  36.2 
 
 
284 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0010  HemK family modification methylase  36.13 
 
 
279 aa  156  4e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.175416  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.57 
 
 
280 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  35.66 
 
 
279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.68 
 
 
284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.79 
 
 
314 aa  155  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  37.89 
 
 
286 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  35.54 
 
 
304 aa  155  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  35.94 
 
 
286 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  34.36 
 
 
286 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  38.13 
 
 
294 aa  155  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  36.05 
 
 
277 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.89 
 
 
286 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  38.57 
 
 
280 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  34.36 
 
 
286 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>