More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0106 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  71.97 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  74.9 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  67.48 
 
 		 261 aa  348  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  49.21 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  47.58 
 
 		 279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  48.44 
 
 		 288 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  46.77 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  46.77 
 
 		 279 aa  241  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  52.92 
 
 		 284 aa  240  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  48.47 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  48.08 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  46.59 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  46.97 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  46.97 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  46.97 
 
 		 319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  46.97 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  46.97 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  48.88 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  46.97 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  49.19 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  48.4 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  48.88 
 
 		 268 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  46.21 
 
 		 304 aa  231  9e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  47.97 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  50.41 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  46.32 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  46.72 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  43.43 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  47.86 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  47.24 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  47.24 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.06 
 
 		 282 aa  228  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  45.76 
 
 		 288 aa  228  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  47.81 
 
 		 285 aa  228  9e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  42.14 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  46.18 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  47.43 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  47.01 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  48.03 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  48.41 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  44.09 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  45.8 
 
 		 342 aa  222  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  45.7 
 
 		 287 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  44.15 
 
 		 275 aa  222  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  44.96 
 
 		 342 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  40.36 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  51.9 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  41.98 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  48.39 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  45.2 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  42.69 
 
 		 270 aa  214  8e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  47.37 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  44.49 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  44.09 
 
 		 289 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  44.19 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  49.79 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  46.19 
 
 		 251 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  40 
 
 		 318 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  50.6 
 
 		 175 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  39.29 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  58.46 
 
 		 147 aa  168  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  43.23 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  40.25 
 
 		 229 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  45 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  45.41 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  40.83 
 
 		 239 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  43.5 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  39.17 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  39.13 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  37.77 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  40.62 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  38.6 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  41.63 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  37.24 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  38.4 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  43.52 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  38.79 
 
 		 220 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  38.68 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  37.34 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  37.34 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  39.45 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  38.68 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  38.68 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  38.68 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  42.4 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  37.72 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  39.8 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  37.33 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  42.86 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  40.37 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  39.62 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  37.39 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  38.28 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  37.39 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  38.39 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  37.39 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  37.39 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  37.39 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>