More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0207 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  100 
 
 
203 aa  422  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  86.63 
 
 
203 aa  371  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  85.64 
 
 
203 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  84.65 
 
 
203 aa  362  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  83.17 
 
 
203 aa  361  3e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  77.72 
 
 
203 aa  347  9e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  76.62 
 
 
203 aa  335  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  60.8 
 
 
200 aa  268  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.62 
 
 
277 aa  164  8e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.07 
 
 
284 aa  160  8.000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.04 
 
 
284 aa  154  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.04 
 
 
284 aa  154  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.75 
 
 
286 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.67 
 
 
298 aa  147  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.84 
 
 
278 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.96 
 
 
283 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.21 
 
 
277 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  40.53 
 
 
312 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.47 
 
 
309 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.57 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.31 
 
 
291 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  40.31 
 
 
291 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.51 
 
 
329 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.55 
 
 
281 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.03 
 
 
286 aa  134  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.39 
 
 
288 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.09 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.11 
 
 
276 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.89 
 
 
290 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.43 
 
 
280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  40.84 
 
 
285 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.11 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.86 
 
 
296 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.5 
 
 
306 aa  129  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.37 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  35.94 
 
 
344 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.41 
 
 
150 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.39 
 
 
127 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.12 
 
 
281 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.26 
 
 
207 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.24 
 
 
154 aa  122  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.31 
 
 
294 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  47.2 
 
 
149 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  48.03 
 
 
143 aa  121  6e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  36.79 
 
 
294 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  47.58 
 
 
144 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.34 
 
 
291 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.76 
 
 
131 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  49.18 
 
 
128 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  46.97 
 
 
129 aa  119  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  47.58 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.11 
 
 
293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  47.2 
 
 
138 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  47.58 
 
 
144 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.58 
 
 
142 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.2 
 
 
133 aa  118  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  45.16 
 
 
145 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  46.4 
 
 
132 aa  117  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.6 
 
 
133 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.6 
 
 
133 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  48 
 
 
143 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  47.97 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  48.36 
 
 
133 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  48.44 
 
 
125 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  46.4 
 
 
139 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  47.45 
 
 
173 aa  116  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  47.58 
 
 
129 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.31 
 
 
128 aa  115  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  45.6 
 
 
132 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.36 
 
 
128 aa  114  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  46.4 
 
 
150 aa  114  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  44 
 
 
132 aa  114  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.24 
 
 
142 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.8 
 
 
133 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  47.54 
 
 
133 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  47.11 
 
 
137 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  46.4 
 
 
124 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  44.62 
 
 
135 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  44.62 
 
 
135 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.04 
 
 
135 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  48 
 
 
128 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  44.78 
 
 
135 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  47.24 
 
 
128 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  48 
 
 
128 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  48 
 
 
128 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  48 
 
 
128 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1492  FeS cluster assembly scaffold IscU  47.54 
 
 
128 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  45.86 
 
 
134 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  47.24 
 
 
128 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  48 
 
 
128 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0950  scaffold protein  47.54 
 
 
133 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.850633  normal  0.0311736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0885  scaffold protein  47.54 
 
 
133 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.541754  normal  0.110729 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5431  scaffold protein  44.62 
 
 
135 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113721  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  45.24 
 
 
129 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  47.2 
 
 
128 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  46.4 
 
 
127 aa  111  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  43.75 
 
 
128 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1026  scaffold protein  45.9 
 
 
133 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00834233  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 
123 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  45.6 
 
 
137 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>