More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8411 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
463 aa  897    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.61 
 
 
475 aa  520  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.27 
 
 
461 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.41 
 
 
483 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  54.37 
 
 
494 aa  485  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.75 
 
 
506 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.99 
 
 
515 aa  478  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.29 
 
 
491 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.21 
 
 
491 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  54.97 
 
 
487 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.88 
 
 
517 aa  460  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.53 
 
 
491 aa  455  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  56.78 
 
 
488 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  54.68 
 
 
484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.51 
 
 
507 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.26 
 
 
481 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.42 
 
 
480 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  51.99 
 
 
488 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.3 
 
 
486 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.9 
 
 
518 aa  438  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  50.43 
 
 
502 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.56 
 
 
490 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  49.89 
 
 
493 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.34 
 
 
490 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.97 
 
 
484 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.08 
 
 
480 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.01 
 
 
479 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.83 
 
 
498 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.63 
 
 
521 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.26 
 
 
471 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.26 
 
 
471 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.26 
 
 
471 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.03 
 
 
470 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.13 
 
 
470 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.46 
 
 
465 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  49.27 
 
 
496 aa  363  3e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.46 
 
 
460 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  46.37 
 
 
456 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.72 
 
 
456 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.72 
 
 
456 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.61 
 
 
496 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.52 
 
 
438 aa  299  7e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  39.61 
 
 
437 aa  295  9e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.6 
 
 
440 aa  290  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.13 
 
 
442 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.16 
 
 
457 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.08 
 
 
433 aa  282  7.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  36.42 
 
 
444 aa  280  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.58 
 
 
438 aa  276  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.49 
 
 
444 aa  273  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.49 
 
 
444 aa  273  6e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.23 
 
 
441 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.06 
 
 
437 aa  271  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.87 
 
 
460 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.52 
 
 
441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.4 
 
 
442 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0727  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.55 
 
 
458 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.7 
 
 
441 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.51 
 
 
443 aa  265  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  37.88 
 
 
465 aa  265  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  39.13 
 
 
428 aa  264  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  36.06 
 
 
436 aa  264  3e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.38 
 
 
443 aa  263  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.21 
 
 
446 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  38.31 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.68 
 
 
452 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.07 
 
 
430 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.14 
 
 
432 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.34 
 
 
463 aa  260  4e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.87 
 
 
436 aa  259  8e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.32 
 
 
465 aa  258  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.09 
 
 
429 aa  256  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  37.17 
 
 
445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  37.17 
 
 
445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.32 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.17 
 
 
428 aa  254  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  37.17 
 
 
445 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  37.17 
 
 
445 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0039  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.71 
 
 
444 aa  253  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0035  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.71 
 
 
444 aa  253  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.49 
 
 
448 aa  253  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.87 
 
 
431 aa  252  8.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.12 
 
 
436 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.7 
 
 
470 aa  252  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  37.94 
 
 
458 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.86 
 
 
466 aa  251  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  38.36 
 
 
429 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3877  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.71 
 
 
470 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03548  predicted xanthine/uracil permase  35.49 
 
 
444 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03490  hypothetical protein  35.49 
 
 
444 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  35.32 
 
 
429 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0375  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.54 
 
 
473 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0283882  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.07 
 
 
453 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.23 
 
 
471 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  35.49 
 
 
470 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.85 
 
 
449 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0414  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.16 
 
 
482 aa  250  4e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.222193  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  37.92 
 
 
429 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  35 
 
 
435 aa  249  6e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1698  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.93 
 
 
433 aa  249  8e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>