More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6981 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  100 
 
 		 389 aa  774    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  36.55 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7345  histidine kinase  36.69 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0358279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  39.04 
 
 		 413 aa  139  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  34.35 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  39.66 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  39.43 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0512  histidine kinase  40.56 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  32.41 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  39.44 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  33.91 
 
 		 433 aa  123  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 468 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  32.21 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 490 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  34.23 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 		 508 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  38.84 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  38.72 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0643  histidine kinase  35.24 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18540  signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 394 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2026  Two-component protein Kinase  27.61 
 
 		 595 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3228  Two-component protein Kinase  28.67 
 
 		 595 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  36.92 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  30.36 
 
 		 597 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 652 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2996  two component LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 595 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.896317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3291  response regulator receiver domain-containing protein  27.51 
 
 		 592 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  35.18 
 
 		 529 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  34.7 
 
 		 1031 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  32.43 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  34.62 
 
 		 401 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  32.68 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  37.5 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1687  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  33.95 
 
 		 643 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461201  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.07 
 
 		 456 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 352 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  35.19 
 
 		 325 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 748 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 372 aa  99.4  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  32.23 
 
 		 395 aa  97.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  35.38 
 
 		 2361 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 725 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 407 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.39 
 
 		 1648 aa  96.7  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04040  signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 401 aa  96.3  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.631107  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 552 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  30.48 
 
 		 466 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 799 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.54 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 581 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0918  histidine kinase  30.54 
 
 		 405 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 546 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  34.62 
 
 		 457 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  29.9 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 456 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  29.9 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 420 aa  94.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  30.32 
 
 		 466 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  30.3 
 
 		 400 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  33.77 
 
 		 367 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  35.34 
 
 		 432 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  29.38 
 
 		 409 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  32.44 
 
 		 501 aa  93.2  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  30.16 
 
 		 466 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 391 aa  93.2  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 332 aa  93.2  7e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 466 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  28.92 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  28.57 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 466 aa  92.8  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 463 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 466 aa  92.8  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 466 aa  92.8  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  32.18 
 
 		 391 aa  92.8  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  28.92 
 
 		 351 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 440 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 564 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 682 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  31.3 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1101  sensor histidine kinase, putative  30.13 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  33.77 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>