39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2607 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  100 
 
 
755 aa  1497    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3593  hypothetical protein  44.85 
 
 
723 aa  558  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27604  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  48 
 
 
748 aa  360  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  34.72 
 
 
649 aa  149  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  31.96 
 
 
576 aa  137  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07117  conserved hypothetical protein  26.25 
 
 
458 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  24.59 
 
 
790 aa  108  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0632  hypothetical protein  27.75 
 
 
809 aa  95.5  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0657  hypothetical protein  27.75 
 
 
809 aa  95.5  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  31.6 
 
 
1011 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  37.78 
 
 
502 aa  84.7  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.51 
 
 
517 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  34.03 
 
 
932 aa  79  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  31.94 
 
 
750 aa  77.4  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4311  hypothetical protein  29.26 
 
 
1405 aa  77  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.861205  normal  0.589522 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2051  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.96 
 
 
491 aa  73.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  28.28 
 
 
1323 aa  73.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  34.04 
 
 
496 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1740  hypothetical protein  20.82 
 
 
885 aa  69.7  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4312  hypothetical protein  30.53 
 
 
1413 aa  65.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319357  normal  0.568612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  31.88 
 
 
633 aa  61.2  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 
482 aa  58.5  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  29.66 
 
 
530 aa  55.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0441  hypothetical protein  32.46 
 
 
814 aa  53.9  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2672  hypothetical protein  31.07 
 
 
495 aa  52.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  34.74 
 
 
1121 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  28.19 
 
 
1392 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  29.58 
 
 
669 aa  51.6  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  31.47 
 
 
642 aa  51.6  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2060  hypothetical protein  34.38 
 
 
312 aa  51.2  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0412  hypothetical protein  24.24 
 
 
372 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.63 
 
 
694 aa  50.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  21.79 
 
 
503 aa  49.3  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2098  hypothetical protein  32.17 
 
 
373 aa  48.5  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 
437 aa  47.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3517  putative O-antigen related protein  34.12 
 
 
645 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0419564  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  20.14 
 
 
501 aa  47  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  31.52 
 
 
975 aa  45.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  35.53 
 
 
931 aa  44.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>