12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3517 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3517  putative O-antigen related protein  100 
 
 		 645 aa  1336    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0419564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1259  lipolytic protein G-D-S-L family  33.06 
 
 		 725 aa  194  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.437163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2416  hypothetical protein  40 
 
 		 326 aa  166  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3591  hypothetical protein  27.73 
 
 		 451 aa  127  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0183177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4136  hypothetical protein  31 
 
 		 448 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0594523  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2263  hypothetical protein  22.8 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1364  hypothetical protein  18.88 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000024275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2995  hypothetical protein  29.67 
 
 		 369 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0742  hypothetical protein  25.34 
 
 		 365 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2607  hypothetical protein  34.12 
 
 		 755 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.459804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2753  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1597 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264647 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  32.61 
 
 		 649 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>